293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2448 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  97.63 
 
 		 476 aa  880    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  100 
 
 		 476 aa  951    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  36.64 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.82 
 
 		 485 aa  279  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.46 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.93 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.32 
 
 		 473 aa  266  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  34.28 
 
 		 473 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  33.62 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.57 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  34.91 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  35.14 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  34.06 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  35.14 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  34.93 
 
 		 473 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  34.93 
 
 		 473 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.55 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.85 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  29.74 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.33 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.18 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.12 
 
 		 487 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.57 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.51 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.78 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.66 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.23 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.25 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  34.02 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.05 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.56 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.62 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  27.69 
 
 		 493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  27.69 
 
 		 493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  27.69 
 
 		 490 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  27.48 
 
 		 493 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.89 
 
 		 490 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  27.69 
 
 		 493 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.78 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  29.05 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  27.27 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  27.48 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  27.48 
 
 		 536 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  27.27 
 
 		 490 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.18 
 
 		 490 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  27.82 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  26.94 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.27 
 
 		 509 aa  217  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  28.78 
 
 		 483 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.65 
 
 		 488 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.31 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  30.85 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.12 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.59 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.77 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  29.07 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.77 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.77 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.2 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  27.31 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.64 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.4 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.4 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  26.36 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  29.47 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.22 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  29.83 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.85 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.38 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25 
 
 		 484 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.77 
 
 		 495 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  22.87 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25 
 
 		 494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.27 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  26.57 
 
 		 524 aa  166  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.38 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.68 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  23.62 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.38 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.26 
 
 		 464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.36 
 
 		 465 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  22.12 
 
 		 468 aa  126  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  24.63 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  25.63 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  22.22 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  26.77 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  26.02 
 
 		 465 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  25 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.34 
 
 		 465 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  23.48 
 
 		 626 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5196  lysine decarboxylase  20.82 
 
 		 756 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2182  lysine decarboxylase  25 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.198287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2134  lysine decarboxylase  25 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12551  amino acid decarboxylase  20.69 
 
 		 947 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0500695 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1007  L-lysine decarboxylase  23.74 
 
 		 708 aa  87.8  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  25.25 
 
 		 767 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2935  lysine decarboxylase, constitutive  22.78 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2718  lysine decarboxylase, constitutive  22.84 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2760  lysine decarboxylase, constitutive  22.84 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2801  lysine decarboxylase, constitutive  22.84 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>