More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2424 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  99.36 
 
 
466 aa  956    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
466 aa  961    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
468 aa  629  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 
466 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
465 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
466 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
465 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  551  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
468 aa  551  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
465 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 
465 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
470 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
465 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
465 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 
466 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 
472 aa  537  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 
465 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 
466 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
486 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
470 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
485 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 
474 aa  508  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
500 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
481 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
472 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
478 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
480 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
480 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
474 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
477 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
493 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
487 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
487 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 
494 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
485 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
493 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
459 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
481 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
479 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
459 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
459 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
460 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
459 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
447 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
447 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
460 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
476 aa  468  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
455 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
459 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
461 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
484 aa  461  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
460 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
461 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
459 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
468 aa  459  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
478 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
461 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  45.08 
 
 
485 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
460 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
453 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
461 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
465 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
461 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
493 aa  450  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
462 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
462 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
461 aa  448  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>