More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2413 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
173 aa  350  7e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.34964e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
173 aa  350  7e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  2.31541e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  65.5 
 
 
177 aa  237  7e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  63.37 
 
 
172 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.55754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 
174 aa  217  8e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.07525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  59.17 
 
 
172 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.3421e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  57.47 
 
 
174 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.37782e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  54.8 
 
 
175 aa  198  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.2864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  57.06 
 
 
175 aa  197  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.47395e-09  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  56.73 
 
 
175 aa  197  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.72103e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  54.39 
 
 
203 aa  195  2e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  56.32 
 
 
182 aa  194  5e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  56.32 
 
 
182 aa  194  5e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  55.17 
 
 
182 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  58.48 
 
 
175 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.00106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 
177 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  56.98 
 
 
175 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.33733e-06  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  51.12 
 
 
180 aa  185  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.33893e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  51.15 
 
 
207 aa  180  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.95097e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  51.72 
 
 
181 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  53.22 
 
 
174 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.27534e-14  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  51.7 
 
 
176 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.96245e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  56.07 
 
 
177 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.31665e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  53.71 
 
 
183 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  173  1e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.96375e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  172  3e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.81772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  48.02 
 
 
181 aa  171  4e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  3.24122e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.57799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.61698e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  49.11 
 
 
188 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  48.57 
 
 
187 aa  171  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.32326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.76433e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 
177 aa  171  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.09778e-09  unclonable  4.06083e-26 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  50 
 
 
178 aa  171  6e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50 
 
 
181 aa  170  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.64949e-09  unclonable  2.28976e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  48.28 
 
 
194 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.14 
 
 
178 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  2.31337e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  47.06 
 
 
265 aa  167  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  47.13 
 
 
194 aa  166  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  46.55 
 
 
176 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  46.41 
 
 
273 aa  166  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  46.45 
 
 
273 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  47.7 
 
 
273 aa  165  3e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  47.7 
 
 
277 aa  165  3e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 
185 aa  164  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  44.86 
 
 
272 aa  163  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  45.14 
 
 
243 aa  162  2e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  48.28 
 
 
201 aa  162  2e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  43.26 
 
 
266 aa  162  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  44.26 
 
 
266 aa  162  2e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  45.25 
 
 
238 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  44.32 
 
 
280 aa  161  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  44.33 
 
 
276 aa  161  4e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 
250 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  48.59 
 
 
178 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  1.9364e-08 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  42.11 
 
 
272 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  42.93 
 
 
299 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 
266 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  42.78 
 
 
267 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  48.88 
 
 
192 aa  158  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  48.04 
 
 
228 aa  157  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  46.55 
 
 
176 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 
270 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 
270 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  43.17 
 
 
306 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 
271 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.6 
 
 
177 aa  154  5e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  45.51 
 
 
185 aa  154  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  42.77 
 
 
175 aa  154  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  42.08 
 
 
301 aa  153  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  43.92 
 
 
198 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.49386e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  42.11 
 
 
238 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  45.61 
 
 
173 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  44.13 
 
 
242 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  46.47 
 
 
177 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  43.02 
 
 
175 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  44.81 
 
 
267 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  44.13 
 
 
242 aa  151  3e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  45.88 
 
 
177 aa  151  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  47.75 
 
 
262 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  44.51 
 
 
287 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  46.47 
 
 
177 aa  150  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.69889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  43.02 
 
 
175 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  43.02 
 
 
175 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 
179 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  2.7375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  41.88 
 
 
317 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  43.02 
 
 
175 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  4.51246e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  43.02 
 
 
175 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  42.78 
 
 
246 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  43.1 
 
 
188 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  41.62 
 
 
176 aa  147  6e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  40.7 
 
 
180 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 
194 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 
194 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  42.41 
 
 
296 aa  147  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  42.44 
 
 
175 aa  146  1e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>