More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2412 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  282  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.28335e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  282  9e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  9.20277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  77.7 
 
 
141 aa  227  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 
141 aa  223  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  75.54 
 
 
141 aa  222  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 
141 aa  221  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  8.09352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.83134e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82251e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.609e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.40287e-09  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.61724e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  4.60749e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.90069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.12022e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.22779e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  221  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.02685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  78.57 
 
 
141 aa  220  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.18228e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  220  5e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.46948e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  75.54 
 
 
141 aa  220  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.5997e-05  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  71.22 
 
 
141 aa  218  2e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.06726e-06  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
141 aa  217  4e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  7.82975e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
141 aa  216  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
142 aa  216  8e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.58159e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 
140 aa  216  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 
140 aa  216  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 
140 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  75.54 
 
 
140 aa  215  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  70.21 
 
 
142 aa  213  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  73.57 
 
 
140 aa  212  1e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.62355e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 
141 aa  211  2e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.80764e-09  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
141 aa  211  3e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  72.66 
 
 
140 aa  210  4e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  8.24953e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  72.66 
 
 
140 aa  210  4e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  5.66986e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  210  6e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.22987e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
141 aa  209  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  209  7e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  209  8e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  67.38 
 
 
141 aa  209  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
140 aa  208  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  72.66 
 
 
141 aa  207  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  3.30995e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
142 aa  207  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
140 aa  207  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  207  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.86897e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  66.91 
 
 
141 aa  205  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  4.49736e-14  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
140 aa  204  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  204  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  3.02185e-07 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  202  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  201  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
141 aa  200  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  2.73622e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  200  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.38423e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3693  ribosomal protein L11  75.89 
 
 
142 aa  200  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.90781e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
141 aa  199  1e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  199  1e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
140 aa  199  2e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  197  4e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  197  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  66.42 
 
 
163 aa  197  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  8.62042e-05 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  196  1e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 
164 aa  196  1e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  196  1e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  67.86 
 
 
142 aa  195  2e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.46208e-09  unclonable  1.92361e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  195  2e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  194  5e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  66.43 
 
 
140 aa  192  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  62.59 
 
 
143 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
141 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  4.25279e-07  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  192  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  191  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.34652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  67.88 
 
 
162 aa  191  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  2.1546e-08 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  190  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  65.47 
 
 
140 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
140 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 
141 aa  188  3e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  7.89076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
141 aa  187  3e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  3.73457e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
140 aa  188  3e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
141 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
141 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  65.71 
 
 
143 aa  187  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  62.59 
 
 
147 aa  187  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  187  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
140 aa  187  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
144 aa  187  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  63.7 
 
 
148 aa  187  6e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  63.7 
 
 
148 aa  187  6e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  63.7 
 
 
148 aa  187  6e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  65.19 
 
 
142 aa  186  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
143 aa  186  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
145 aa  186  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  62.59 
 
 
144 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
144 aa  186  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>