More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2411 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
229 aa  458  1e-128  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  4.62552e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  100 
 
 
229 aa  458  1e-128  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  5.12351e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  72.69 
 
 
230 aa  356  1e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.27232e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  78.76 
 
 
230 aa  354  5e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  79.2 
 
 
231 aa  354  8e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.27574e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  78.85 
 
 
230 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.85888e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  71.37 
 
 
231 aa  342  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  68.58 
 
 
233 aa  325  2e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  66.37 
 
 
232 aa  322  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  5.01108e-06  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  72.69 
 
 
232 aa  322  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  71.68 
 
 
230 aa  321  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.51678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  66.37 
 
 
233 aa  317  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  64.91 
 
 
235 aa  313  1e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.74523e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  65.64 
 
 
231 aa  312  3e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  67.7 
 
 
229 aa  306  1e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.98509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  68.58 
 
 
230 aa  306  2e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  66.22 
 
 
233 aa  305  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.40107e-13  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  64.29 
 
 
231 aa  295  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  60.44 
 
 
241 aa  294  8e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  64 
 
 
233 aa  294  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  69.47 
 
 
233 aa  292  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  63.88 
 
 
233 aa  292  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  63.84 
 
 
230 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  6.9455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  63.84 
 
 
230 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.52195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  65.02 
 
 
233 aa  292  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.44477e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  64.89 
 
 
234 aa  291  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17065e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  69.03 
 
 
233 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.32548e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  63.56 
 
 
234 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  63 
 
 
233 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1146  ribosomal protein L1  64.91 
 
 
236 aa  288  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.84572e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  60.81 
 
 
236 aa  287  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  286  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.71982e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  69.82 
 
 
230 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.53199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.40164e-08  unclonable  7.07039e-26 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1822  ribosomal protein L1  57.52 
 
 
242 aa  286  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 
233 aa  285  3e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  57.02 
 
 
242 aa  285  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.43327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.05875e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.82446e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  6.78721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 
233 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  69.37 
 
 
230 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.39498e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 
233 aa  285  6e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  58.93 
 
 
230 aa  283  2e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  60.62 
 
 
234 aa  282  4e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  60.18 
 
 
235 aa  281  5e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  4.30301e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  58.44 
 
 
242 aa  281  5e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  68.92 
 
 
230 aa  281  8e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.4838e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  58.56 
 
 
235 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  59.56 
 
 
235 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 
233 aa  279  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  58.41 
 
 
235 aa  279  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  6.49528e-09  unclonable  2.62625e-08 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 
230 aa  278  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  57.46 
 
 
234 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  57.85 
 
 
235 aa  277  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  57.4 
 
 
232 aa  276  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  64.02 
 
 
229 aa  275  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  57.14 
 
 
237 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 
242 aa  271  5e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  2.26656e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  56 
 
 
236 aa  271  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3327  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 
240 aa  270  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24535  normal  0.407372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  57.89 
 
 
230 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  61.11 
 
 
234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  61.11 
 
 
234 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  61.11 
 
 
234 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  56.31 
 
 
238 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 
238 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  56.89 
 
 
259 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 
236 aa  267  9e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  61.65 
 
 
235 aa  267  9e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  61.79 
 
 
234 aa  266  3e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  59.03 
 
 
232 aa  265  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  55.75 
 
 
234 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  56.95 
 
 
235 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 
229 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  55.11 
 
 
238 aa  262  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 
229 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  55.56 
 
 
238 aa  261  9e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 
232 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  57.71 
 
 
229 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 
235 aa  259  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  55.91 
 
 
237 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  55.41 
 
 
226 aa  259  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  58.41 
 
 
234 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 
232 aa  257  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2952  ribosomal protein L1  59.19 
 
 
235 aa  257  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00907027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.39 
 
 
231 aa  256  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  56.94 
 
 
225 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 
227 aa  257  1e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  58.33 
 
 
231 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 
233 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 
229 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 
230 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  58.8 
 
 
232 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55.61 
 
 
232 aa  255  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  56.89 
 
 
231 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36712e-07 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 
235 aa  255  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>