More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2397 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
97 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  58.7 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 
98 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
95 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 
94 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 
97 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
95 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
94 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
94 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  53.76 
 
 
96 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
95 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
96 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  54.35 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 
94 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  52.63 
 
 
97 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 
101 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 
97 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  51.61 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  46.67 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
98 aa  95.1  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  54.35 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  50.56 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  52.81 
 
 
99 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  52.17 
 
 
100 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
94 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 
94 aa  93.2  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
97 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
94 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
94 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  51.69 
 
 
95 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  49.48 
 
 
97 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  46.24 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  49.45 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
98 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  52.5 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
100 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
117 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
100 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
100 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 
105 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  50.56 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50.53 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  48.89 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  48.35 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
103 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  45.26 
 
 
96 aa  84.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
103 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  46.24 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  48.39 
 
 
96 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
100 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  46.67 
 
 
100 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  46.51 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  46.74 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>