More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2394 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  60 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  57.27 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  58.72 
 
 		 114 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  60 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  57.8 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  58.88 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  58.18 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  58.33 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  53.7 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  59.26 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  56.36 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  54.55 
 
 		 113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  50.93 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  53.91 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  58.49 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  51.96 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  51.96 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  56.48 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  57.69 
 
 		 212 aa  114  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  50.91 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 120 aa  114  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  49.09 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  55.88 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  48.25 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3662  50S ribosomal protein L22  50 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  57.41 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  51.3 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  50.96 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  50.43 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  50.91 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  45.95 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  52.78 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  48.21 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 119 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  49.57 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  48.54 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1845  50S ribosomal protein L22  49.07 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000645692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  47.32 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  52.29 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  49.54 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2683  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143954  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  50.46 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>