More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2382 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 165 aa  320  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 165 aa  320  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  75.76 
 
 		 166 aa  248  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  74.7 
 
 		 167 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  70.12 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  69.09 
 
 		 166 aa  240  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  68.9 
 
 		 166 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  68.29 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  68.71 
 
 		 168 aa  224  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  68.71 
 
 		 166 aa  223  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  68.1 
 
 		 168 aa  223  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  65.85 
 
 		 166 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  67.07 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  68.9 
 
 		 167 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  67.07 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  64.63 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 166 aa  210  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 168 aa  207  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  68 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  61.64 
 
 		 173 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 166 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  66.67 
 
 		 166 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  64.71 
 
 		 206 aa  198  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 169 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  59.01 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  64.56 
 
 		 162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  61.73 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 168 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  61.39 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  62.66 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  61.49 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  61.78 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 163 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0380  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 166 aa  184  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  58.02 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  62.66 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 180 aa  183  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  56.17 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 163 aa  180  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 163 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  58.28 
 
 		 197 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  56.44 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  59.88 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  54.09 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  53.37 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05805  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  57.67 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 182 aa  177  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  54.32 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0998  ribosomal protein S5  57.69 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.476174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  59.51 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0337  30S ribosomal protein S5  55.13 
 
 		 172 aa  173  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0478966  hitchhiker  0.00120208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0492  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.166117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0266  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118791  hitchhiker  0.0081122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1941  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2615  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3759  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0375867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3787  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.773313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3495  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3729  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00614597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3152  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  57.06 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3051  30S ribosomal protein S5  54.49 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0155994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  55.77 
 
 		 190 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1268  ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2822  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137287  normal  0.25953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  56.58 
 
 		 202 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3162  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.02216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4259  ribosomal protein S5  51.85 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144419  unclonable  0.00000000000259852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>