280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2366 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  100 
 
 
268 aa  533  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  99.25 
 
 
268 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  57.14 
 
 
267 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  59.7 
 
 
268 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  55.65 
 
 
269 aa  300  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  55.95 
 
 
270 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  56.15 
 
 
263 aa  288  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  56.15 
 
 
263 aa  288  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  58.56 
 
 
262 aa  287  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  59.36 
 
 
265 aa  271  8.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  48.68 
 
 
264 aa  248  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  50.62 
 
 
267 aa  248  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  44.96 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  49.19 
 
 
265 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  47.98 
 
 
265 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  46.12 
 
 
266 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  43.89 
 
 
264 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  45.75 
 
 
266 aa  224  9e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  45.28 
 
 
268 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  45.28 
 
 
268 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  44.4 
 
 
264 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  44.4 
 
 
264 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  44.4 
 
 
264 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  44.4 
 
 
264 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  44.4 
 
 
264 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  44.4 
 
 
264 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  44.06 
 
 
264 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  44 
 
 
264 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  43.51 
 
 
264 aa  221  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  44 
 
 
264 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2124  cobalt transport protein  44.86 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.213962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0247  cobalt transport protein  40.6 
 
 
269 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.224698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  39.41 
 
 
267 aa  210  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  44.8 
 
 
264 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  43.03 
 
 
267 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  41.67 
 
 
268 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  41.6 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  39.16 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  44.76 
 
 
267 aa  193  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  40 
 
 
264 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  36.29 
 
 
259 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  33.6 
 
 
265 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  33.73 
 
 
275 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  40.32 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
336 aa  163  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  36.07 
 
 
269 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0455  cobalt transport protein  35.89 
 
 
263 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  36.73 
 
 
271 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  33.45 
 
 
332 aa  158  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.42 
 
 
269 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  36.43 
 
 
271 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24080  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  37.59 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2300  cobalt ABC transporter permease protein  36.4 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000489641  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  46.05 
 
 
438 aa  150  3e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  34.32 
 
 
255 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.35 
 
 
810 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  32.83 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2799  cobalt transport protein  32.45 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161091  hitchhiker  0.0000401783 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1836  cobalt transport protein  33.2 
 
 
244 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.507525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
770 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0583  cobalt transport family protein  35.8 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0352  cobalt transport protein  26.79 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1964  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit  32.09 
 
 
255 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19680  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.89 
 
 
231 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0554754  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  33.06 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  30.08 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  30.8 
 
 
255 aa  99  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.79 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1194  putative biotin ABC transporter, permease protein  27.68 
 
 
217 aa  95.5  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3687  cobalt transport protein  28 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1130  cobalt transport protein  32.75 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1751  cobalt transport protein  27.68 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253796  normal  0.0321598 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.87 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3551  cobalt ABC transporter, permease protein  29.56 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401892  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01470  Cobalt transport protein  23.12 
 
 
350 aa  89  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0260035  normal  0.244881 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  27.92 
 
 
257 aa  88.6  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  30.25 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  28.89 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3660  cobalt transport protein  28.05 
 
 
196 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.24 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2867  cobalt transport protein  24.82 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3229  cobalt transport protein  24.82 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1229  cobalt transport protein  31.85 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.379694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.55 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  29.52 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3565  cobalt transport protein  21.65 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0616568  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  26.17 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0884  cobalt transport protein  22.66 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  27.84 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  23.89 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1067  cobalt transport protein  27.6 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1302  cobalt transport protein  25.3 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0789486  normal  0.0436887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1608  cobalt transport protein  27.54 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  26.72 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  23.24 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3687  cobalt transport protein  25.91 
 
 
210 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.600557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  25.19 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  22.89 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>