More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2350 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  97.12 
 
 
104 aa  207  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  50.96 
 
 
106 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  55.45 
 
 
104 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  55.45 
 
 
104 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  119  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  54.46 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  54.9 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  51.52 
 
 
109 aa  117  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  49.52 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  49.52 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  53.47 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  51.52 
 
 
109 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  54.9 
 
 
105 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  48.48 
 
 
109 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  50.98 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  51.96 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.46 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  53.19 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  48.57 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  50.51 
 
 
109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  51.96 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  51.96 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  53.54 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  52.13 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.04 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  50.96 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  49.02 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  53.47 
 
 
110 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  48.48 
 
 
109 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  47.06 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  47.47 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  49.49 
 
 
108 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  47.52 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  51.58 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  51.52 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  52.04 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  48.04 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  51.06 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  49.52 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  50.5 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  50.98 
 
 
113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  50.98 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  48.08 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  56.67 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  49.04 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  51.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  51.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  51.06 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.67 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  49.02 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  47.52 
 
 
107 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50 
 
 
116 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  47.06 
 
 
108 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  48.51 
 
 
110 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  47.52 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  51.55 
 
 
106 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  49.04 
 
 
106 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  47.06 
 
 
141 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  50.51 
 
 
106 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  49.48 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>