More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2197 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  100 
 
 
381 aa  770  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  95.51 
 
 
381 aa  739  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  41.08 
 
 
374 aa  285  7e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  40.16 
 
 
375 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  39.89 
 
 
375 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
374 aa  213  4e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
386 aa  185  1e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  35.76 
 
 
434 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
435 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
382 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
378 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
383 aa  174  2e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  1.99281e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
400 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
395 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
395 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
370 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
393 aa  166  6e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
420 aa  166  6e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.79 
 
 
381 aa  164  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
408 aa  163  4e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
385 aa  163  5e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
376 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
371 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
397 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
366 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  37.59 
 
 
351 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
444 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
394 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
394 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
380 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
850 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
377 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  30.34 
 
 
846 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
846 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
370 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 
380 aa  148  1e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
381 aa  148  1e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
382 aa  149  1e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
860 aa  148  1e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  28.25 
 
 
859 aa  148  1e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  33.45 
 
 
1232 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
838 aa  146  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
370 aa  146  7e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
366 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
1089 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
366 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
609 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
1028 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
1261 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
393 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.21 
 
 
815 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
357 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
355 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
369 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
1398 aa  142  1e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
398 aa  142  1e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
366 aa  142  1e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
375 aa  141  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
384 aa  141  2e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
346 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  28.89 
 
 
346 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
831 aa  141  2e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
387 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 
387 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
366 aa  140  5e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
386 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
1915 aa  139  8e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.86 
 
 
373 aa  138  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
437 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
394 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
398 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
431 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.53773e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
361 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
360 aa  136  6e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.24 
 
 
430 aa  136  7e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 
361 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
535 aa  135  2e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
1241 aa  135  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
1229 aa  135  2e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
374 aa  134  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
381 aa  134  2e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
373 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
371 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
417 aa  133  4e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
381 aa  132  1e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  25 
 
 
380 aa  131  2e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
340 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
380 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
381 aa  129  8e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
384 aa  129  1e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
1241 aa  128  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
376 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
360 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.91 
 
 
361 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
364 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.21 
 
 
353 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
381 aa  125  8e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 
364 aa  126  8e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
381 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
382 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>