26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2196 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  95.82 
 
 
335 aa  661    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  100 
 
 
335 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30.06 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  29.75 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  30.28 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  27.95 
 
 
330 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  31.38 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  25.71 
 
 
327 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  27.19 
 
 
359 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  27.19 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  26.21 
 
 
349 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  24.38 
 
 
342 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  24.46 
 
 
342 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  24.24 
 
 
331 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  25.67 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  21.96 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  26.25 
 
 
352 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  25.91 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  22.96 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  24.26 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  23.05 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  20.47 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.76 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  22.22 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2120  aminoglycoside phosphotransferase  20.61 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  36.9 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>