38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2194 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  100 
 
 
342 aa  677  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  96.49 
 
 
342 aa  652  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30.72 
 
 
334 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  30.38 
 
 
333 aa  132  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  30.99 
 
 
330 aa  128  2e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  27.94 
 
 
327 aa  115  8e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  25.38 
 
 
329 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  24.46 
 
 
335 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  24.38 
 
 
335 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  23.65 
 
 
347 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  28.33 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  23.73 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25.34 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.65 
 
 
331 aa  84  3e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  24.27 
 
 
372 aa  81.3  2e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  23.53 
 
 
350 aa  80.1  6e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  23.28 
 
 
337 aa  76.6  6e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  24.81 
 
 
345 aa  75.9  1e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  25.3 
 
 
355 aa  72  1e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  25.61 
 
 
359 aa  69.3  8e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  24.91 
 
 
359 aa  68.9  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  23.03 
 
 
352 aa  65.9  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  21.33 
 
 
364 aa  51.6  2e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4577  spore coat protein YsxE  22.26 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1644  aminoglycoside phosphotransferase  22.97 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3175  spore coat protein YsxE  20.52 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2828  hypothetical protein  27.12 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00879234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4304  spore coat protein YsxE  21.38 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0657  spore coat protein YsxE  21.43 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4546  spore coat protein YsxE  20.79 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  21.57 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4203  spore coat protein  20.52 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4550  hypothetical protein  20.79 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4192  spore coat protein  20.2 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  37.29 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1727  homoserine kinase  20.52 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4691  hypothetical protein  20.49 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4356  hypothetical protein  20.49 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>