17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2183 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2183  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  277  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2473  hypothetical protein  97.12 
 
 
139 aa  269  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0611  hypothetical protein  46.67 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2411  hypothetical protein  37.12 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000174546  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0051  hypothetical protein  34.71 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857319  decreased coverage  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1936  hypothetical protein  37.19 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000001254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0284  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00312794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0049  hypothetical protein  32.74 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.016779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4847  Domain of unknown function DUF1934  31.88 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000272971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3789  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000167321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3184  hypothetical protein  25.96 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000116642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18080  hypothetical protein  26.98 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.792053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2037  hypothetical protein  28.78 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.11582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0228  hypothetical protein  29.82 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000249728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3349  hypothetical protein  27.19 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0261  hypothetical protein  28.18 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>