More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2177 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  100 
 
 
587 aa  1189  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  2.99232e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  98.47 
 
 
587 aa  1175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  48.99 
 
 
308 aa  286  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  45.45 
 
 
318 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.56327e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  44.78 
 
 
308 aa  266  9e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  44.85 
 
 
301 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  45.51 
 
 
301 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  44 
 
 
304 aa  245  2e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  42.43 
 
 
313 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  44.67 
 
 
308 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.67473e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  42.12 
 
 
308 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  44.63 
 
 
307 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  45.08 
 
 
317 aa  241  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  41.72 
 
 
295 aa  240  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.22593e-11  hitchhiker  1.14155e-08 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  44.07 
 
 
316 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  44.79 
 
 
292 aa  236  1e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.04727e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  44.71 
 
 
302 aa  234  2e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  44.67 
 
 
532 aa  235  2e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.52863e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  45.39 
 
 
293 aa  226  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.96549e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  42.16 
 
 
291 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.82e-09  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  43.71 
 
 
318 aa  221  2e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  44.9 
 
 
294 aa  218  3e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  40.27 
 
 
313 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  41.48 
 
 
301 aa  208  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  40.89 
 
 
304 aa  206  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  6.72255e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  40.96 
 
 
285 aa  206  8e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  42.76 
 
 
279 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  40.49 
 
 
313 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  36.66 
 
 
327 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  39.22 
 
 
285 aa  199  2e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  35.91 
 
 
292 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  35.24 
 
 
311 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
302 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  40.91 
 
 
295 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.47112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  36.27 
 
 
342 aa  191  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  37.58 
 
 
306 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  39.55 
 
 
283 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  37.58 
 
 
306 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  40.4 
 
 
296 aa  190  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  40.4 
 
 
296 aa  190  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  36.93 
 
 
306 aa  190  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  34.97 
 
 
302 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  37.25 
 
 
306 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  37.25 
 
 
306 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  36.93 
 
 
306 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  37.25 
 
 
306 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  37.25 
 
 
306 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  37.88 
 
 
307 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  31.56 
 
 
391 aa  189  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  38.13 
 
 
320 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  6.18498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  36.93 
 
 
306 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  37.63 
 
 
289 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  35.67 
 
 
308 aa  185  2e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  37.06 
 
 
352 aa  185  2e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  35.91 
 
 
311 aa  184  4e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  34.64 
 
 
315 aa  183  9e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  37.34 
 
 
359 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  36.05 
 
 
314 aa  180  6e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  34.7 
 
 
335 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.65 
 
 
283 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.74977e-08  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  38.25 
 
 
285 aa  176  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  8.57444e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  36.45 
 
 
337 aa  176  1e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.6 
 
 
283 aa  174  4e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
283 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.61 
 
 
279 aa  174  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.13381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
283 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  35.69 
 
 
288 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.95 
 
 
283 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.17496e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  38.6 
 
 
283 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.01 
 
 
285 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.95 
 
 
283 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  38.25 
 
 
283 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  38.25 
 
 
283 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.4912e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  37.38 
 
 
307 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  4.75051e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  37.05 
 
 
307 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  37.89 
 
 
283 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.50241e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  37.89 
 
 
283 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.3 
 
 
300 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  7.94612e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  35.47 
 
 
324 aa  167  6e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.19 
 
 
291 aa  167  6e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.17 
 
 
284 aa  166  1e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  35.11 
 
 
285 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.33725e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.93 
 
 
284 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.62 
 
 
321 aa  164  5e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  1.02093e-12  hitchhiker  9.56396e-11 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  35.67 
 
 
306 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  34.02 
 
 
361 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  34.42 
 
 
298 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36.26 
 
 
295 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  35.38 
 
 
285 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  40.52 
 
 
319 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  35.11 
 
 
293 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  32.73 
 
 
284 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  34.07 
 
 
317 aa  157  5e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  32.57 
 
 
304 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  32.74 
 
 
289 aa  156  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  35.23 
 
 
280 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.74 
 
 
287 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  34.19 
 
 
285 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  33.92 
 
 
282 aa  154  3e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.57803e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  35.77 
 
 
288 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>