More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2176 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  100 
 
 
360 aa  741  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  100 
 
 
360 aa  741  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 
359 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 
356 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  63.29 
 
 
355 aa  468  1e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  64.39 
 
 
360 aa  470  1e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 
356 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  65.82 
 
 
356 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
355 aa  458  1e-128  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
355 aa  461  1e-128  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
355 aa  458  1e-128  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
358 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 
355 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 
358 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 
355 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 
355 aa  452  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  62.08 
 
 
357 aa  454  1e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 
359 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
357 aa  445  1e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 
355 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  60.23 
 
 
355 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  60.6 
 
 
359 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.47 
 
 
355 aa  441  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  5.09235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 
355 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 
355 aa  440  1e-122  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 
356 aa  440  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  55.97 
 
 
359 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 
355 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.29315e-09  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 
354 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 
358 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.77535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  56.7 
 
 
358 aa  428  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  1.76457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  57.66 
 
 
358 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  59.04 
 
 
358 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  56.82 
 
 
355 aa  424  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 
358 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.42042e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  56.34 
 
 
355 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 
356 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
356 aa  424  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
362 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 
358 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 
358 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  61.02 
 
 
355 aa  418  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  3.18273e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 
367 aa  418  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  415  1e-115  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  53.95 
 
 
357 aa  415  1e-115  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 
355 aa  416  1e-115  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  54.21 
 
 
360 aa  417  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 
362 aa  415  1e-115  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  8.01734e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  415  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 
355 aa  417  1e-115  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 
357 aa  416  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 
360 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 
360 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  54.13 
 
 
361 aa  411  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  53.78 
 
 
361 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 
353 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01250  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
362 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 
360 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  53.93 
 
 
360 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
361 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
361 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2449  peptide chain release factor 1  57.38 
 
 
359 aa  408  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  4.10243e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  54.47 
 
 
363 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2045  peptide chain release factor 1  56.02 
 
 
355 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  54.78 
 
 
361 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  52.81 
 
 
360 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  53.37 
 
 
360 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
362 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  54.06 
 
 
363 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  54.34 
 
 
363 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.15596e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
360 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1618  peptide chain release factor 1  55.52 
 
 
355 aa  406  1e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 
361 aa  406  1e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 
363 aa  407  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
361 aa  404  1e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 
360 aa  407  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  52.25 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 
360 aa  407  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1599  peptide chain release factor 1  56.5 
 
 
355 aa  404  1e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  53.5 
 
 
363 aa  405  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
361 aa  404  1e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.09 
 
 
360 aa  405  1e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 
360 aa  407  1e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2563  peptide chain release factor 1  55.37 
 
 
362 aa  407  1e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.273749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  54.49 
 
 
360 aa  405  1e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.69 
 
 
360 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>