229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2137 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  99.11 
 
 		 447 aa  893    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  100 
 
 		 447 aa  897    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.03 
 
 		 1103 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  28.09 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.62 
 
 		 674 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  34.39 
 
 		 552 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  34.39 
 
 		 552 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  33.33 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  26.09 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.53 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35.32 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.63 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  28.65 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  34.44 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.08 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.77 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.72 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.4 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.61 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.58 
 
 		 549 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.63 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  31.56 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.17 
 
 		 598 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.15 
 
 		 944 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.84 
 
 		 548 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  27.88 
 
 		 534 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.57 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.82 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  28.38 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  27.8 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  27.27 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  27.7 
 
 		 552 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  31.22 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  32.8 
 
 		 560 aa  69.7  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.18 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  32.95 
 
 		 545 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.21 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  28.5 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.87 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  31.5 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  28.8 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.08 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.8 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.5 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  33.33 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  26.55 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.49 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.09 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  27.35 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  26.11 
 
 		 346 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  32.04 
 
 		 334 aa  67  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  41.18 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  26.99 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  32.8 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  38.33 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.01 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  42.53 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.54 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  37.19 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.15 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  27.27 
 
 		 775 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.22 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.38 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  24.81 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  28.87 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  32.03 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.68 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.38 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.83 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  25.39 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  24.86 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.32 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  24.63 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.03 
 
 		 539 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.71 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.37 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  28.99 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.73 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.38 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.84 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.35 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.73 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.02 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.41 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  23.58 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  38.79 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  27.78 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  27.78 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.51 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.14 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.42 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  27.36 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  35.19 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.59 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  28.02 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.17 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.1 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  28.49 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.47 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  24.35 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>