149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2121 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  99 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.98 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  28.19 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  29.26 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  28.72 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  28.72 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  28.72 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  28.72 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  28.19 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  28.19 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  27.13 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  32.45 
 
 		 1390 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2950  sporulation inhibitor KapD  26.56 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  29.53 
 
 		 1433 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.24 
 
 		 1367 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.24 
 
 		 1367 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3593  exonuclease  29.53 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.14 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  29.03 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.91 
 
 		 1407 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  28.83 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  26.09 
 
 		 1426 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.54 
 
 		 178 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  26.59 
 
 		 1440 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 		 721 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.67 
 
 		 715 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  22.64 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  26.45 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.42 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  27.04 
 
 		 1421 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.03 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  25.96 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  28.29 
 
 		 1465 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.08 
 
 		 201 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  29.94 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  23.96 
 
 		 617 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.48 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  25.48 
 
 		 243 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  27.52 
 
 		 1397 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  23.03 
 
 		 183 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  27.27 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  25.58 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  23.4 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  24.63 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  28.05 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.37 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.94 
 
 		 729 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  26.22 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.98 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  26.22 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  22.37 
 
 		 183 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  21.71 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  26.37 
 
 		 1449 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  26.9 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.04 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.71 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  22.4 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  26.46 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.5 
 
 		 960 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  22.77 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  28.08 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  22.77 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.37 
 
 		 1449 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  22.77 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  22.77 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.67 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  25.5 
 
 		 1442 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  29.17 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  24.26 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.01 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  22.55 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08390  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  27.01 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  22.55 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  23.41 
 
 		 245 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  29.65 
 
 		 720 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.7 
 
 		 228 aa  45.8  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  22.55 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  22.77 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  26.44 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  24.39 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  26.16 
 
 		 1435 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.06 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>