More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2111 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  96.92 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  53.88 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  52.05 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  52.05 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  52.05 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  52.05 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  51.6 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  52.05 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  51.14 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  50.68 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  51.14 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  49.52 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  48.67 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  49.32 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  46.49 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  45.98 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.91 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  44.2 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  42.42 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  44.3 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44.16 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  43.72 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  42.67 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  44.74 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  42.98 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  44.64 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  43.23 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  43.69 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  43.23 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  42.6 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  47.12 
 
 		 213 aa  174  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  40.79 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  43.11 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  48.88 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  42.41 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  39.82 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  41.13 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  41.13 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  41.26 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  40.65 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 233 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  37.5 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 224 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  34.67 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  44.44 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  36.68 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  44.32 
 
 		 185 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  37.73 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>