More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2110 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  99.71 
 
 		 342 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  69.62 
 
 		 343 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  68.34 
 
 		 340 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  69.6 
 
 		 343 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  67.06 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  68.58 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  68.69 
 
 		 339 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  64.78 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.32 
 
 		 350 aa  451  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  65.58 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  63.61 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  64.76 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 		 339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  65.96 
 
 		 368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  63.83 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  64.12 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  62.1 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.96 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  65.28 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.02 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  65.1 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  62.39 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.54 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  62.02 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  60.59 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  60.88 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  60.82 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  60.29 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  65.17 
 
 		 346 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.13 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  61.19 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.41 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  62.5 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  61.33 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  59.39 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  61.19 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  61.16 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  62.42 
 
 		 335 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  61.59 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  58.68 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  58.59 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  59 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  55.88 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.52 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  57.82 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  58.62 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  57.1 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  61.04 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  56.46 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  58.28 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  55.16 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  56.46 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  57.64 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.79 
 
 		 339 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  60.36 
 
 		 358 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  61.76 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  56.72 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  54.05 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  58.88 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  55.75 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  57.45 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  58.21 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  57.62 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  58.61 
 
 		 346 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>