272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2109 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  99.65 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  31.52 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.94 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  23.91 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  29.97 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  24.82 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  24.42 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  23.7 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.03 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.54 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 243 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  24.09 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  24.18 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  21.24 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  26.81 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  23.42 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  22.26 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  21.89 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  22.68 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  22.46 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  23.46 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  23.88 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  25.21 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  25.71 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>