More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2105 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
265 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  3.28791e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  100 
 
 
265 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  5.89774e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1306  septum site-determining protein MinD  61.45 
 
 
266 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.07586e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2129  septum site-determining protein MinD  60.84 
 
 
265 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.39479e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4346  septum site-determining protein MinD  63.74 
 
 
264 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000124781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  62.31 
 
 
260 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  64.89 
 
 
266 aa  340  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.69346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0542  septum site-determining protein MinD  60.75 
 
 
263 aa  337  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.32714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  60.31 
 
 
264 aa  335  4e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  64.66 
 
 
264 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1636  septum site-determining protein MinD  61.3 
 
 
266 aa  335  6e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  59.47 
 
 
267 aa  331  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0093  septum site-determining protein MinD  63.74 
 
 
266 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.03093e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  63.2 
 
 
265 aa  329  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.20626e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  59.09 
 
 
267 aa  329  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  56.49 
 
 
265 aa  321  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  321  9e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  56.11 
 
 
265 aa  320  1e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  58.02 
 
 
264 aa  315  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  54.55 
 
 
266 aa  315  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0520  septum site-determining protein MinD  58.02 
 
 
265 aa  310  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  58.24 
 
 
266 aa  309  3e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  54.37 
 
 
265 aa  306  2e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1281  septum site-determining protein MinD  57.89 
 
 
263 aa  305  4e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0634588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  55.88 
 
 
273 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  53.79 
 
 
266 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1558  septum site-determining protein MinD  55.34 
 
 
270 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.859979  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3409  septum site-determining protein MinD  54.96 
 
 
270 aa  296  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224611  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  52.59 
 
 
269 aa  289  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1461  septum site-determining protein MinD  54.75 
 
 
266 aa  285  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0376  septum site-determining protein MinD  55.89 
 
 
266 aa  285  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  53.26 
 
 
267 aa  284  1e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  54.58 
 
 
264 aa  283  2e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0932  septum site-determining protein MinD  52.87 
 
 
267 aa  283  2e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.602666 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1399  septum site-determining protein MinD  58.33 
 
 
264 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  3.34804e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3349  septum site-determining protein MinD  55.38 
 
 
265 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2768  septum site-determining protein MinD  55.38 
 
 
265 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  52.27 
 
 
260 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1259  septum site-determining protein MinD  54.51 
 
 
266 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130783  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  52.85 
 
 
266 aa  266  3e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  52.51 
 
 
268 aa  265  6e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3383  septum site-determining protein MinD  51.71 
 
 
268 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  51.35 
 
 
268 aa  260  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  50.19 
 
 
268 aa  257  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3507  cell division inhibitor  47.76 
 
 
271 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00615597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  45.25 
 
 
271 aa  254  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.4274e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  47.94 
 
 
271 aa  254  1e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  47.94 
 
 
274 aa  254  1e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  45.11 
 
 
269 aa  252  4e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  45.69 
 
 
267 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  48.5 
 
 
269 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  48.5 
 
 
269 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  46.69 
 
 
271 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  46.52 
 
 
271 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  48.13 
 
 
271 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0260  septum site-determining protein MinD  45.32 
 
 
273 aa  248  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.148495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1325  septum site-determining protein MinD  46.07 
 
 
270 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1283  septum site-determining protein MinD  45.32 
 
 
270 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126659  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35120  septum site-determining protein MinD  45.32 
 
 
271 aa  244  1e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.53185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  45.11 
 
 
268 aa  244  1e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04464  septum site-determining protein MinD  45.63 
 
 
269 aa  244  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1095  septum site-determining protein MinD  46.01 
 
 
269 aa  244  1e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3067  septum site-determining protein MinD  46.13 
 
 
269 aa  243  2e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1837  septum site-determining protein MinD  45.69 
 
 
269 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1694  septum site-determining protein MinD  44.4 
 
 
270 aa  242  4e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1733  septum site-determining protein MinD  44.94 
 
 
270 aa  242  4e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.270038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3986  septum site-determining protein MinD  44.94 
 
 
270 aa  242  4e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.346846  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4341  septum site-determining protein MinD  45.15 
 
 
271 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.243396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1234  septum site-determining protein MinD  44.03 
 
 
271 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246291  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1935  septum site-determining protein MinD  44.94 
 
 
269 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  44.74 
 
 
269 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  43.49 
 
 
270 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  47.76 
 
 
272 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1364  septum site-determining protein MinD  44.89 
 
 
271 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  44.19 
 
 
269 aa  239  3e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.53952e-08  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  43.82 
 
 
269 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.43693e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  43.82 
 
 
269 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.78028e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  44.19 
 
 
269 aa  238  6e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2372  cell division inhibitor MinD  45.15 
 
 
270 aa  238  6e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000838785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1881  cell division inhibitor MinD  43.28 
 
 
271 aa  238  7e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  45.35 
 
 
271 aa  238  7e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  43.49 
 
 
270 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.45956e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2150  septum site-determining protein MinD  45.08 
 
 
270 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.74777e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22020  cell division inhibitor MinD  43.28 
 
 
271 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0588924  hitchhiker  5.94989e-14 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  44.7 
 
 
276 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  3.80987e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  44.94 
 
 
269 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.42736e-08  unclonable  1.74808e-06 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1590  septum site-determining protein MinD  44.87 
 
 
269 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.17933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  43.87 
 
 
270 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  44.03 
 
 
270 aa  236  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.29404e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1328  cell division inhibitor MinD  44.03 
 
 
270 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000634164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2450  cell division inhibitor MinD  44.03 
 
 
270 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00994868  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1319  cell division inhibitor MinD  44.03 
 
 
270 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.02659e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>