117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2104 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2104  cell division topological specificity factor MinE  100 
 
 
90 aa  177  3e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.84529e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2392  cell division topological specificity factor MinE  98.89 
 
 
90 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  8.29737e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2557  cell division topological specificity factor MinE  40.22 
 
 
94 aa  76.6  9e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.83914e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0094  cell division topological specificity factor MinE  39.08 
 
 
94 aa  73.6  8e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000217477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2369  cell division topological specificity factor MinE  42.05 
 
 
90 aa  70.9  5e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0155059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21901  cell division topological specificity factor MinE  40.48 
 
 
126 aa  68.6  3e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.892996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3333  cell division topological specificity factor MinE  39.29 
 
 
91 aa  67.8  5e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0369939  normal  0.713516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0897  cell division topological specificity factor MinE  38.1 
 
 
91 aa  67.4  6e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0560402  hitchhiker  0.00587681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1460  cell division topological specificity factor MinE  38.46 
 
 
89 aa  65.1  3e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.799074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2128  cell division topological specificity factor MinE  36.78 
 
 
91 aa  64.3  6e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.73264e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1204  cell division topological specificity factor MinE  34.07 
 
 
94 aa  63.2  1e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0521  cell division topological specificity factor MinE  40.54 
 
 
79 aa  62.4  2e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.617236  hitchhiker  0.000386475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04121  cell division topological specificity factor MinE  44.05 
 
 
115 aa  62.4  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0552098  normal  0.388875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1307  cell division topological specificity factor MinE  44 
 
 
100 aa  62.4  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.25469e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1697  cell division topological specificity factor MinE  44.87 
 
 
115 aa  62.4  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.743987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3384  cell division topological specificity factor MinE  36.59 
 
 
95 aa  61.6  3e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1316  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1533  cell division topological specificity factor MinE  36.14 
 
 
95 aa  60.8  5e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.183546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0543  cell division topological specificity factor MinE  35.23 
 
 
98 aa  60.1  9e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.90425e-07  normal  0.758266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2542  cell division topological specificity factor MinE  35.23 
 
 
92 aa  60.1  1e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.958579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0480  cell division topological specificity factor MinE  35.44 
 
 
102 aa  59.7  1e-08  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.689847  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0326  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 
111 aa  58.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1258  cell division topological specificity factor MinE  36 
 
 
121 aa  58.5  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0812089  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03461  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 
111 aa  58.5  3e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1854  cell division topological specificity factor MinE  39.02 
 
 
95 aa  58.2  4e-08  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0713629  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03521  cell division topological specificity factor MinE  41.18 
 
 
105 aa  58.2  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3348  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
96 aa  57.8  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2769  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
96 aa  57.8  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.296613  normal  0.0661713 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03561  cell division topological specificity factor MinE  44.78 
 
 
103 aa  57.4  6e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.217865  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03441  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 
108 aa  57  8e-08  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.61963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1994  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 
100 aa  56.2  1e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.829432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3479  cell division topological specificity factor MinE  37.33 
 
 
97 aa  56.6  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0837361  normal  0.579917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3018  cell division topological specificity factor MinE  40 
 
 
97 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1282  cell division topological specificity factor MinE  33.73 
 
 
92 aa  56.2  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0546704  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4345  cell division topological specificity factor MinE  29.63 
 
 
91 aa  53.1  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.95585e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1635  septum site-determining protein  35.53 
 
 
90 aa  52  3e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0732475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1166  cell division topological specificity factor MinE  41.1 
 
 
84 aa  51.6  3e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.3438e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3408  cell division topological specificity factor MinE  28.89 
 
 
87 aa  50.8  5e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.350756  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0345  septum site-determining protein  37.65 
 
 
81 aa  50.4  8e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0011  cell division topological specificity factor MinE  36.62 
 
 
83 aa  50.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0012  cell division topological specificity factor MinE  36.62 
 
 
83 aa  50.1  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3506  cell division topological specificity factor MinE  38.46 
 
 
86 aa  48.5  3e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0458207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3987  cell division topological specificity factor MinE  36.11 
 
 
84 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1732  cell division topological specificity factor MinE  36.11 
 
 
84 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.656764  normal  0.252053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14180  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
79 aa  47.8  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.96332e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1324  cell division topological specificity factor MinE  36.11 
 
 
84 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3423  cell division topological specificity factor MinE  32.95 
 
 
87 aa  47.8  5e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00102224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0277  cell division topological specificity factor MinE  34.25 
 
 
85 aa  47.8  6e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.510649  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1365  cell division topological specificity factor MinE  31.08 
 
 
88 aa  47.4  7e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1557  cell division topological specificity factor MinE  31.11 
 
 
87 aa  47.4  8e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0503  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 
96 aa  47  8e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.92083  normal  0.0267759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1693  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357465  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1553  cell division topological specificity factor MinE  30.77 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.326791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1735  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2112  cell division topological specificity factor MinE  35.71 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.81978e-06  normal  0.32779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1282  cell division topological specificity factor MinE  34.72 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120256  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2186  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.16075e-09  hitchhiker  2.19314e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1627  cell division topological specificity factor MinE  34.72 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.60845e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1702  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.378486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1893  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.38456e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2426  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.06409e-07  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1900  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.10514e-07  normal  0.522204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3373  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2883  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1866  cell division topological specificity factor MinE  32.39 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.16087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3343  cell division topological specificity factor MinE  30.99 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0634  cell division topological specificity factor MinE  34.29 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0371939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0506  septum formation topological specificity factor MinE  32.93 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1689  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1690  cell division topological specificity factor MinE  34.85 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1398  cell division topological specificity factor MinE  26.19 
 
 
80 aa  43.9  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000955334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22010  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.609699  hitchhiker  2.71778e-11 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1880  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0065  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0034  cell division topological specificity factor MinE  36.49 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.748014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2578  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1352  cell division topological specificity factor MinE  29.76 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1763  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.38663e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2521  cell division topological specificity factor MinE  32.86 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.4687e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3343  cell division topological specificity factor MinE  33.78 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0607141  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5652  cell division topological specificity factor MinE  30.3 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.375925  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2384  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.4177e-09  normal  0.288717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2175  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.03577e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1233  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236843  normal  0.296312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2446  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.25931e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28147  predicted protein  26.83 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908244  decreased coverage  0.00612417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2304  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3423  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2252  cell division topological specificity factor MinE  31.43 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  2.26469e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0869  cell division topological specificity factor MinE  32.35 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1219  cell division topological specificity factor MinE  32.88 
 
 
98 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.594254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2414  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6588  cell division topological specificity factor MinE  27.54 
 
 
86 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.898114  hitchhiker  0.00722875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3366  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1996  cell division topological specificity factor MinE  29.35 
 
 
94 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0870829  normal  0.302162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1934  cell division topological specificity factor MinE  34.72 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1611  cell division topological specificity factor MinE  33.33 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.209596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3065  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 
84 aa  40.8  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4342  cell division topological specificity factor MinE  30 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.302634 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0801  cell division topological specificity factor MinE  31.94 
 
 
84 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4711  cell division topological specificity factor MinE  31.67 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274995  decreased coverage  0.00834487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>