More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2103 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  98.66 
 
 
374 aa  728  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  100 
 
 
374 aa  735  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  3.19192e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.89 
 
 
380 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.62 
 
 
379 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 
365 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.7 
 
 
388 aa  222  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.02 
 
 
369 aa  222  1e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 
368 aa  221  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  36.15 
 
 
378 aa  221  2e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.11075e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 
373 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 
398 aa  214  2e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
378 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  38.66 
 
 
357 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 
377 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
371 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.79 
 
 
366 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 
363 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.88 
 
 
384 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 
412 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.58 
 
 
371 aa  200  4e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  33.69 
 
 
369 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 
372 aa  196  5e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.51 
 
 
366 aa  196  8e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.67 
 
 
374 aa  195  9e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 
387 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.24977e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  35.73 
 
 
423 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  32.17 
 
 
390 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  34.41 
 
 
368 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.43295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  30.97 
 
 
374 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
368 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  32.31 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  32.31 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.70795e-05  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  32.31 
 
 
367 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  38.68 
 
 
388 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 
366 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 
373 aa  190  3e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1634  cell cycle protein  33.16 
 
 
391 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.07 
 
 
422 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  36.23 
 
 
422 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  30.77 
 
 
378 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 
371 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 
407 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  31.28 
 
 
404 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.23269e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  30.98 
 
 
367 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  36.02 
 
 
422 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 
366 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
372 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.24 
 
 
363 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  34.4 
 
 
371 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  32.34 
 
 
413 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
368 aa  184  2e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  30.43 
 
 
426 aa  184  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  32.53 
 
 
374 aa  184  2e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0779  cell cycle protein  30.96 
 
 
390 aa  184  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  33.6 
 
 
366 aa  184  2e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
368 aa  184  2e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  4.70166e-07 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  32.15 
 
 
367 aa  184  2e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
368 aa  184  2e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.78779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  32.03 
 
 
368 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  35.59 
 
 
376 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  32.34 
 
 
366 aa  183  5e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  31.2 
 
 
368 aa  183  5e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  1.62732e-09 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.32 
 
 
367 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 
417 aa  182  9e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 
417 aa  182  9e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  32.09 
 
 
381 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  32.61 
 
 
366 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  32.16 
 
 
371 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  31.38 
 
 
401 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  35.21 
 
 
360 aa  180  3e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  9.09205e-07 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  32.71 
 
 
386 aa  181  3e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  31.17 
 
 
379 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.95 
 
 
419 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32 
 
 
368 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 
403 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.27 
 
 
368 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  36.06 
 
 
387 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  32.23 
 
 
360 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  32.51 
 
 
364 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  37.28 
 
 
373 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  32.81 
 
 
374 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  30.92 
 
 
368 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 
359 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 
368 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  30.64 
 
 
368 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  32.96 
 
 
373 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.47199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4083  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  33.67 
 
 
386 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  30.22 
 
 
407 aa  176  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  32.11 
 
 
382 aa  175  1e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  30.81 
 
 
373 aa  175  1e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  30.83 
 
 
382 aa  175  1e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  32.59 
 
 
379 aa  175  1e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.1 
 
 
417 aa  175  1e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  31 
 
 
421 aa  175  1e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  32.59 
 
 
379 aa  175  1e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1325  cell cycle protein FtsW  34.69 
 
 
386 aa  175  1e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  36.84 
 
 
370 aa  174  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
384 aa  173  4e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  1.32704e-13 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  31.75 
 
 
368 aa  173  4e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.82729e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1287  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  34.1 
 
 
386 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>