More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2040 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  49.92 
 
 		 654 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  50.85 
 
 		 653 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 654 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 654 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  49.31 
 
 		 654 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 654 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  50.62 
 
 		 656 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  49.85 
 
 		 641 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 632 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2326  DNA topoisomerase IV subunit B  99.85 
 
 		 648 aa  1332    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2040  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 648 aa  1333    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 		 644 aa  638    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  49.77 
 
 		 649 aa  651    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  49.31 
 
 		 654 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  49 
 
 		 654 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  49.92 
 
 		 654 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  49.31 
 
 		 654 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 645 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 654 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 650 aa  631  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  48.55 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  47.25 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  46.75 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  49.46 
 
 		 633 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  47.85 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 		 633 aa  609  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  47.85 
 
 		 663 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  47.3 
 
 		 634 aa  611  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  46.01 
 
 		 649 aa  608  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  47.85 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.2 
 
 		 638 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  47.68 
 
 		 642 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  45.54 
 
 		 628 aa  598  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  47.68 
 
 		 638 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  46.66 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  46.19 
 
 		 636 aa  594  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  45.45 
 
 		 637 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  45.4 
 
 		 633 aa  594  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  46.67 
 
 		 640 aa  588  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  45.68 
 
 		 644 aa  591  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  47.3 
 
 		 638 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  47.15 
 
 		 638 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.98 
 
 		 636 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  47.98 
 
 		 640 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  45.68 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  46.25 
 
 		 645 aa  579  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  45.62 
 
 		 644 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  48.77 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  47.66 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  46.06 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  46.3 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  45.48 
 
 		 637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  46.06 
 
 		 674 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  47.22 
 
 		 650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  46.15 
 
 		 643 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  45.36 
 
 		 651 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  44.57 
 
 		 637 aa  572  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  47.2 
 
 		 635 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  47.69 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  47.21 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  47.99 
 
 		 640 aa  571  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  48.29 
 
 		 627 aa  568  1e-161  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  44.51 
 
 		 654 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  45.52 
 
 		 637 aa  568  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  44.2 
 
 		 641 aa  568  1e-160  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  47.53 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  45.3 
 
 		 649 aa  566  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  47.38 
 
 		 640 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  44.24 
 
 		 643 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  45.34 
 
 		 674 aa  564  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 		 647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  45.83 
 
 		 643 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  45.26 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  46.15 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  45.29 
 
 		 633 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  45.23 
 
 		 642 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  44.14 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  46.17 
 
 		 648 aa  561  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  44.12 
 
 		 649 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  46.19 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  45.15 
 
 		 644 aa  557  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  45.71 
 
 		 642 aa  555  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  44.82 
 
 		 648 aa  554  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  44.05 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  45.47 
 
 		 661 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  46.82 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  45.45 
 
 		 652 aa  552  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  44.1 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  41.85 
 
 		 636 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  42.45 
 
 		 675 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  43.59 
 
 		 659 aa  548  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  44.49 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>