104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2033 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  41.73 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  41.73 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  40.71 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  37.86 
 
 		 141 aa  95.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  35.94 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  32.14 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  31.69 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  30.71 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  32.88 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  31.71 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.22 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  30.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  31.08 
 
 		 403 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  26.21 
 
 		 404 aa  57.4  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  25.37 
 
 		 391 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 397 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 401 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  34.41 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  24.66 
 
 		 500 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.18 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.97 
 
 		 505 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.97 
 
 		 494 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.29 
 
 		 503 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 407 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28831  flavodoxin:flavin reductase-like domain-containing protein  27.15 
 
 		 615 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  25.52 
 
 		 396 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.92 
 
 		 485 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.45 
 
 		 504 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  24.67 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.45 
 
 		 498 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  24.83 
 
 		 399 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.83 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 387 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  21.38 
 
 		 479 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 387 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  21.38 
 
 		 479 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  23.45 
 
 		 493 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  24.83 
 
 		 393 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 		 200 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  23.78 
 
 		 407 aa  43.9  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00471  flavoprotein  27.14 
 
 		 613 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4139  flavoprotein WrbA  33.72 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384114  unclonable  0.00000000000397831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  25.36 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1697  flavodoxin FldA  27.69 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0608  TrpR binding protein WrbA  31.58 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.47 
 
 		 396 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 387 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  28 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  20.69 
 
 		 479 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 400 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  29.17 
 
 		 569 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  26.89 
 
 		 405 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  27.07 
 
 		 147 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  26.81 
 
 		 399 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  37.93 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.87 
 
 		 400 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  27.47 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 387 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1859  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 		 585 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  29.86 
 
 		 570 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  32.63 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  26.81 
 
 		 399 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1369  flavin reductase-like, FMN-binding  30 
 
 		 575 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.018202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  27.07 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  23.08 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  25 
 
 		 406 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1724  ATPase  30.63 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 576 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>