231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2021 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  99.29 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  61.76 
 
 
146 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  61.59 
 
 
146 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  62.32 
 
 
146 aa  175  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  61.59 
 
 
146 aa  174  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  61.59 
 
 
146 aa  174  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  61.59 
 
 
141 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  60.14 
 
 
146 aa  173  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  58.7 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55 
 
 
153 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.4 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  58.7 
 
 
143 aa  156  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  58.27 
 
 
157 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52.14 
 
 
142 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  51.11 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  49.26 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45 
 
 
146 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  58.33 
 
 
154 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  43.07 
 
 
148 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  46.04 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  41.01 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  28.47 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  28.47 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  27.74 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  28.47 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  27.74 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  27.74 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  27.74 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  27.01 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  26.28 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  38.68 
 
 
309 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  26.28 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.15 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  33.08 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  33.08 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  37.5 
 
 
307 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0967  sensor histidine kinase  28.03 
 
 
401 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  31.16 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
144 aa  48.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  30.3 
 
 
473 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
566 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
321 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.46 
 
 
321 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  28.33 
 
 
601 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
588 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
154 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  39.06 
 
 
680 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  30.14 
 
 
454 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4084  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3633  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  25.74 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  27.72 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3653  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4123  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.24 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  30.1 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  30.65 
 
 
556 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0740  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.69 
 
 
470 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.350353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.06 
 
 
286 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.76 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
466 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
750 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
579 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.5 
 
 
543 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
506 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  31.63 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
545 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
632 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  28.57 
 
 
632 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  25.58 
 
 
457 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>