More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1987 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  99.66 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 301 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 298 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  55.67 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 301 aa  328  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 301 aa  328  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 		 297 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  49.31 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  49.31 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  47.93 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  52.9 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  48.8 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  47.95 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 299 aa  290  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 		 293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.6 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  44.75 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  45.76 
 
 		 301 aa  275  7e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.96 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.83 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 		 299 aa  258  9e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 		 311 aa  257  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  43.33 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 337 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  43.54 
 
 		 318 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 449 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  43.84 
 
 		 468 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  41.16 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 489 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  39.66 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.44 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  39.86 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  39.13 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  40 
 
 		 314 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  41.5 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 		 301 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  41.36 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  40.21 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  41.78 
 
 		 451 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  39.18 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  39.04 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>