More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1931 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  64.68 
 
 		 479 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  64.26 
 
 		 480 aa  634    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  64.68 
 
 		 479 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  64.47 
 
 		 479 aa  634    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  64.68 
 
 		 479 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  64.68 
 
 		 479 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  98.5 
 
 		 466 aa  905    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  100 
 
 		 466 aa  921    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  64.26 
 
 		 480 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  64.68 
 
 		 481 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  64.47 
 
 		 479 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  64.04 
 
 		 479 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  64.04 
 
 		 480 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  64.16 
 
 		 470 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  62.23 
 
 		 476 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  62.45 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  62.23 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  62.66 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  62.23 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  62.66 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  62.23 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  64.24 
 
 		 458 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  61.8 
 
 		 476 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  59.66 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  59.66 
 
 		 477 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  58.58 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  59.66 
 
 		 477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  59.44 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  59.44 
 
 		 477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  59.44 
 
 		 477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  59.66 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  59.44 
 
 		 477 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  60.66 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  59.23 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  60.3 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  60.3 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  60.3 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  60.3 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  60.09 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  60.09 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  53.25 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  52.44 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  50.32 
 
 		 543 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  57.05 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  50.75 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  50.75 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  50.75 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  57.05 
 
 		 486 aa  482  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  50.97 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  52.87 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  50.75 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  50.75 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  51.4 
 
 		 504 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  50.75 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  51.17 
 
 		 495 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  51.18 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  51.49 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  50.54 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  50.75 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  51.18 
 
 		 497 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  51.18 
 
 		 497 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  51.18 
 
 		 497 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  52.34 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  51.37 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  49.58 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  51.85 
 
 		 483 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  51.61 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  51.61 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  50.43 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  50.85 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  48.34 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  50.77 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  46.72 
 
 		 457 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  49.15 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  44.23 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00400  amino acid carrier protein  46.96 
 
 		 523 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  49.26 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  49.05 
 
 		 480 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  46.93 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  49.45 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  50 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2933  sodium/alanine symporter family protein, C-terminus  60.93 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.736541  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  48 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  45.36 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  48.16 
 
 		 479 aa  425  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  49.89 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  48.42 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  48.42 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  49.46 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  48.21 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  47.16 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  44.52 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  47.79 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  45.35 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5513  amino acid carrier protein  46.97 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538617  normal  0.636918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19510  amino acid carrier protein  47.47 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  48.15 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  47.28 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  48 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>