283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1911 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
89 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
89 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  45.78 
 
 
118 aa  76.6  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
121 aa  75.1  3e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.30502e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  52.63 
 
 
90 aa  73.6  8e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 
91 aa  72.8  1e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  37.08 
 
 
90 aa  72.8  2e-12  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  37.08 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 
95 aa  72.4  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  37.08 
 
 
90 aa  72.4  2e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
108 aa  72  3e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
108 aa  71.2  4e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  39.47 
 
 
108 aa  70.5  7e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  44.29 
 
 
121 aa  70.1  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
103 aa  69.7  1e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
93 aa  69.7  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  40.79 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  41.79 
 
 
111 aa  68.6  3e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
116 aa  68.6  3e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  41.56 
 
 
108 aa  68.6  3e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
90 aa  68.2  4e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
116 aa  68.2  4e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
133 aa  67.4  6e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  38.82 
 
 
91 aa  67.4  6e-11  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 
91 aa  67  7e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.07658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
99 aa  66.6  9e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
113 aa  66.2  1e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  44.93 
 
 
91 aa  65.5  2e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0145  protein translocase subunit yajC  44 
 
 
107 aa  65.9  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0155516  hitchhiker  0.00195414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  46.38 
 
 
107 aa  65.9  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
116 aa  65.1  3e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
120 aa  65.1  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 
127 aa  65.5  3e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
109 aa  65.1  3e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 
108 aa  64.7  4e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 
178 aa  64.7  5e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.98 
 
 
108 aa  64.3  5e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.96 
 
 
106 aa  64.3  5e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
123 aa  63.9  7e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
110 aa  63.9  7e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  43.33 
 
 
109 aa  63.9  7e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
106 aa  63.9  7e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  40.62 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
143 aa  63.9  7e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  41.82 
 
 
94 aa  63.5  8e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
92 aa  63.5  8e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
110 aa  63.2  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 
96 aa  62.8  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
110 aa  63.2  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  34.12 
 
 
93 aa  63.2  1e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
90 aa  62.8  1e-09  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
129 aa  63.5  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 
110 aa  62.8  1e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  43.55 
 
 
91 aa  63.2  1e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2441  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 
97 aa  63.2  1e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.00189e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  35.53 
 
 
109 aa  62.4  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 
137 aa  62.4  2e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  43.1 
 
 
105 aa  62.4  2e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  41.94 
 
 
109 aa  62  2e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  40.3 
 
 
119 aa  62.4  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  39.19 
 
 
114 aa  62.8  2e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
105 aa  62.4  2e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  38.33 
 
 
111 aa  62.4  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
116 aa  62  2e-09  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  41.54 
 
 
93 aa  62  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  39.47 
 
 
102 aa  62  3e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
106 aa  61.6  3e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  41.94 
 
 
110 aa  62  3e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
111 aa  61.6  3e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  4e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 
114 aa  61.2  4e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  34.21 
 
 
109 aa  61.6  4e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.55 
 
 
94 aa  61.6  4e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0531  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
93 aa  61.2  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.1 
 
 
106 aa  60.8  5e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
110 aa  61.2  5e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
86 aa  61.2  5e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  61.2  5e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
110 aa  61.2  5e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
108 aa  60.8  5e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  32.89 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 
110 aa  60.8  6e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  49.02 
 
 
143 aa  60.5  7e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  41.56 
 
 
112 aa  60.8  7e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  38.24 
 
 
116 aa  60.5  8e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.00527e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
126 aa  60.5  8e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  38.24 
 
 
116 aa  60.5  9e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.75528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1216  protein translocase subunit yajC  39.06 
 
 
112 aa  60.1  1e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.366662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>