More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1878 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1878  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.17322e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2167  polysaccharide deacetylase family protein  95.74 
 
 
258 aa  498  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.11858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  44.08 
 
 
255 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  36.58 
 
 
256 aa  166  3e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  37.13 
 
 
263 aa  164  2e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 
259 aa  158  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
258 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
258 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42029e-05 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 
238 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1162  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  37.69 
 
 
321 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00597989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.48 
 
 
244 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2055  sporulation protein, polysaccharide deacetylase family  37.19 
 
 
327 aa  134  1e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 
295 aa  134  2e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2458  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  39 
 
 
299 aa  132  7e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0476664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0908  xylanase/chitin deacetylase  32.31 
 
 
235 aa  132  8e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  37.81 
 
 
368 aa  130  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.8992e-12  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
251 aa  130  2e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3853  putative polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
299 aa  129  4e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.14111e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3657  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
299 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3817  putative polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
299 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.29688e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3547  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
299 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3943  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
299 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3844  polysaccharide deacetylase, putative  37.5 
 
 
299 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3565  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
299 aa  128  7e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3669  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 
250 aa  127  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3904  putative polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
299 aa  127  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.04 
 
 
251 aa  127  2e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07960  polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 
228 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38 
 
 
250 aa  125  8e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3628  sporulation protein polysaccharide deacetylase YlxY  35.18 
 
 
299 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 
263 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  35.23 
 
 
279 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1451  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 
337 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.708112  normal  0.175155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1948  polysaccharide deacetylase  31.49 
 
 
249 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.15916e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1340  putative polysaccharide deacetylase  35.18 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.236296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2674  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.01 
 
 
250 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0198792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
413 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 
247 aa  120  2e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 
372 aa  120  2e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
267 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1306  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  31.35 
 
 
271 aa  118  8e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 
321 aa  117  2e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
294 aa  116  4e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5017  polysaccharide deacetylase family protein  33.17 
 
 
211 aa  116  4e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 
302 aa  115  8e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1605  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
248 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0764982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.38 
 
 
275 aa  114  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0398  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4834  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.3 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0424  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
275 aa  114  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  7.43733e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0411  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0470  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.3 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0540  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.3 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0217877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0402  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0540  polysaccharide deacetylase, putative  34.3 
 
 
260 aa  114  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0489  delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  34.3 
 
 
260 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
317 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
261 aa  113  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0404  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  33.5 
 
 
260 aa  112  4e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 
285 aa  112  4e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
705 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
275 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.83766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1074  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
320 aa  112  7e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0121745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 
281 aa  112  7e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 
275 aa  112  8e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 
542 aa  111  1e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0150  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5154  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.47 
 
 
254 aa  110  2e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000487832  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0150  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00655873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0182  putative polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.67721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
465 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  31.73 
 
 
244 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  31.72 
 
 
417 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0143  xylanase/chitin deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  29.3 
 
 
488 aa  109  4e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0341  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
335 aa  109  4e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  30.47 
 
 
254 aa  109  4e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0351  polysaccharide deacetylase  41.06 
 
 
176 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0410  Delta-lactam-biosynthetic de-N-acetylase  32.06 
 
 
260 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0163  putative polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.07726e-15 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0145  xylanase/chitin deacetylase  30.47 
 
 
254 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1324  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
360 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.116073  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0571  polysaccharide deacetylase  34.54 
 
 
309 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  34.87 
 
 
276 aa  108  7e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0172  putative polysaccharide deacetylase  30.08 
 
 
254 aa  108  8e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
273 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.97 
 
 
264 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.69 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
537 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 
244 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
199 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31 
 
 
204 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0144  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  29.55 
 
 
258 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00172673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 
352 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>