More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1788 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  100 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  97.59 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  49.44 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  47.22 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  49.44 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  46.94 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  44.17 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  44.84 
 
 		 295 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  44.14 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.32 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  42.31 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  45.58 
 
 		 297 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  44.88 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  45.95 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.91 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  41.96 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  40.37 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.35 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  44.92 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  40.85 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  46 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  44.11 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  46.09 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  45.85 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  41.75 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.53 
 
 		 300 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  43.18 
 
 		 294 aa  215  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  40 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  40.93 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  40.36 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  40.36 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  42 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.9 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  43.15 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  38.82 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  42.44 
 
 		 294 aa  208  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  45.56 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  45.56 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 327 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.43 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  45.26 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.69 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  43.07 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  40.07 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  46.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  46.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  46.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  43.25 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  46.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  46.77 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  39.68 
 
 		 337 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  40.7 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  43.17 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  43.17 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  42.29 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  39.26 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  41.07 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  40.33 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  36.42 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.73 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  37.46 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  40.77 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  42.7 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  40.45 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  37.5 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  46.95 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  38.81 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  37.67 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  40.15 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  39.18 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  41.09 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0754  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.08 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000103665  hitchhiker  0.0000280825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  39.41 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  36.3 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  38.28 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  37.36 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  37.5 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  40.67 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  42.31 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  36.3 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>