More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1755 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  100 
 
 
398 aa  814  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  100 
 
 
398 aa  814  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  64.69 
 
 
394 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  64.69 
 
 
398 aa  535  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  65.45 
 
 
384 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  65.97 
 
 
384 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  63.33 
 
 
394 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  64.62 
 
 
396 aa  515  1e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  61.83 
 
 
398 aa  514  1e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  60.46 
 
 
398 aa  511  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  61.52 
 
 
399 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  63.75 
 
 
393 aa  507  1e-142  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  61.93 
 
 
404 aa  507  1e-142  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  57.72 
 
 
393 aa  493  1e-138  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  60.21 
 
 
396 aa  488  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  59.43 
 
 
392 aa  484  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  58.18 
 
 
400 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  57.7 
 
 
392 aa  471  1e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  57.33 
 
 
388 aa  457  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  60.98 
 
 
392 aa  454  1e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  55.3 
 
 
398 aa  454  1e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  57.25 
 
 
414 aa  447  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  56.7 
 
 
402 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  57.81 
 
 
390 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  51.79 
 
 
389 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  53.12 
 
 
382 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  53.98 
 
 
394 aa  420  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  52.27 
 
 
409 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  52.22 
 
 
396 aa  416  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  53.11 
 
 
400 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.28 
 
 
395 aa  407  1e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  52.34 
 
 
382 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  52.08 
 
 
403 aa  400  1e-110  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  53.7 
 
 
379 aa  398  1e-110  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  52.22 
 
 
396 aa  400  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.48 
 
 
404 aa  399  1e-110  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  48.74 
 
 
436 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  48.74 
 
 
436 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  50.77 
 
 
407 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  50.13 
 
 
407 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
407 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
407 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  48.99 
 
 
403 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
407 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.87 
 
 
407 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  48.99 
 
 
403 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  50 
 
 
407 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  52.32 
 
 
400 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.97 
 
 
403 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  53.66 
 
 
401 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  49.61 
 
 
404 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  48.87 
 
 
407 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  50.26 
 
 
405 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  49.74 
 
 
405 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  50.13 
 
 
389 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
407 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  49.11 
 
 
407 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  50.26 
 
 
405 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
407 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  50.89 
 
 
410 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  51.04 
 
 
403 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  49.61 
 
 
493 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 
384 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 
405 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.36 
 
 
405 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  50.64 
 
 
404 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  48.45 
 
 
393 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  50.26 
 
 
405 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.52 
 
 
399 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  49.87 
 
 
417 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
404 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  48.59 
 
 
391 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  50.13 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
389 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  48.33 
 
 
405 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.43977e-09  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  51.57 
 
 
401 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  49.24 
 
 
408 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  48.84 
 
 
404 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  48.58 
 
 
389 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.38 
 
 
398 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.6 
 
 
402 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  51.57 
 
 
401 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.26 
 
 
388 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  50.64 
 
 
422 aa  380  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  48.19 
 
 
405 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  48.46 
 
 
404 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  49.23 
 
 
419 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  49.36 
 
 
391 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
383 aa  375  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  51.04 
 
 
394 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
406 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
400 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.873822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>