More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1754 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  100 
 
 		 142 aa  294  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  74.83 
 
 		 144 aa  225  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  75.91 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  75 
 
 		 145 aa  220  4.9999999999999996e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  77.17 
 
 		 129 aa  219  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  72.26 
 
 		 143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  74.6 
 
 		 149 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.42 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  70.83 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  70.83 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  68.03 
 
 		 153 aa  191  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.77 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.42 
 
 		 127 aa  190  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  63.41 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.81 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.46 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  58.39 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.66 
 
 		 131 aa  167  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  69.92 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  59.66 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  59.17 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  58.33 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.07 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  58.59 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.17 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  58.59 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  59.2 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  57.81 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  57.81 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  57.81 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  58.59 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  57.81 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  58.73 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  57.81 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  55.04 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  57.03 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  57.81 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  57.03 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  59.06 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  57.48 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.48 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  58.14 
 
 		 128 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.55 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  55.12 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.47 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  55.12 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 291 aa  147  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  57.6 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.3 
 
 		 298 aa  147  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  54.62 
 
 		 291 aa  147  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.04 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  56 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  55.47 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.91 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  57.48 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  56 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.91 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  54.33 
 
 		 133 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  52.71 
 
 		 133 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  55.38 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.91 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  56.69 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  53.78 
 
 		 312 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1443  scaffold protein  52.71 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0899521  normal  0.0121231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  55.2 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.54 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  57.6 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  56.69 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  56.69 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.66 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  53.17 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  56.25 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.33 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  57.14 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.26 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.37 
 
 		 284 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  53.54 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  56.35 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  54.2 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  53.6 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>