More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1733 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
235 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 
235 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  73.89 
 
 
239 aa  345  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  71.93 
 
 
239 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 
239 aa  338  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  72.49 
 
 
239 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  77.31 
 
 
243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  72.17 
 
 
241 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  68.67 
 
 
243 aa  325  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  74.07 
 
 
244 aa  323  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  68.4 
 
 
241 aa  322  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  71.5 
 
 
249 aa  322  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  69.26 
 
 
241 aa  322  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  71.7 
 
 
241 aa  311  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  71.03 
 
 
239 aa  310  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  72.3 
 
 
246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  64.66 
 
 
240 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  68.14 
 
 
249 aa  298  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  63.25 
 
 
245 aa  295  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  64.02 
 
 
242 aa  287  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  62.93 
 
 
244 aa  287  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  54.63 
 
 
234 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  51.22 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  50.23 
 
 
232 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  48.02 
 
 
236 aa  204  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  48.97 
 
 
226 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  49.02 
 
 
244 aa  202  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  47.62 
 
 
231 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  48.48 
 
 
239 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  44.49 
 
 
245 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  48.04 
 
 
236 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.06 
 
 
249 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  45.75 
 
 
233 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  45.75 
 
 
233 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
265 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  45.33 
 
 
237 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  46.12 
 
 
219 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  46.67 
 
 
232 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  46.6 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  48.23 
 
 
149 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  58.06 
 
 
118 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  47.32 
 
 
118 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  55.21 
 
 
114 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  35.2 
 
 
255 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  51.61 
 
 
126 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  32.94 
 
 
259 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.35 
 
 
256 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1311  sporulation sigma factor SigG  33.6 
 
 
269 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000268367  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  31.12 
 
 
257 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 
273 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  31.35 
 
 
260 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  30 
 
 
250 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  31.35 
 
 
257 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  30.19 
 
 
255 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  30.4 
 
 
252 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  29.15 
 
 
257 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  33.06 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  29.15 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  29.89 
 
 
257 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1702  RpoS  28.98 
 
 
303 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0629652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  30.16 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.09 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  30 
 
 
259 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  30.54 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  30.59 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  31.37 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.56 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  29.46 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2771  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000547183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  29.62 
 
 
259 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.72 
 
 
344 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  31.37 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0577  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.84 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4053  sporulation sigma factor SigG  30.16 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000132793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4142  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000821538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4004  sporulation sigma factor SigG  30.98 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3813  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3662  sporulation sigma factor SigG  30.98 
 
 
289 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000167357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3829  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3955  sporulation sigma factor SigG  30.98 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000614575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4294  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.728684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4205  sporulation sigma factor SigF  30.58 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000245022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>