More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1728 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  98.42 
 
 
571 aa  1115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  100 
 
 
571 aa  1129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
581 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
589 aa  319  9e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.11549e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
594 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.43993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
456 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
587 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
589 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
584 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  34.65 
 
 
598 aa  290  5e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
584 aa  285  1e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
592 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
489 aa  279  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
585 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
607 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.91 
 
 
537 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
458 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
581 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.73 
 
 
581 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30 
 
 
581 aa  262  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
582 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  30.03 
 
 
591 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
612 aa  260  5e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
599 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
444 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
587 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
585 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.93 
 
 
587 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
608 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  35.51 
 
 
587 aa  253  5e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  253  5e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  253  5e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
600 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.73 
 
 
587 aa  253  8e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  33.5 
 
 
575 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.75 
 
 
587 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.10325e-07 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.86 
 
 
587 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  34.86 
 
 
587 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
590 aa  251  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
597 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
590 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  35.29 
 
 
587 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
593 aa  241  3e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
591 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
453 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
571 aa  236  1e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
596 aa  235  1e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  32.95 
 
 
599 aa  235  2e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
585 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
554 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  34.95 
 
 
554 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  36.83 
 
 
565 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  33.86 
 
 
584 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
468 aa  227  5e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
571 aa  226  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
602 aa  221  2e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  38.41 
 
 
346 aa  221  2e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.16101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
608 aa  221  4e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
418 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
650 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
621 aa  218  3e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
611 aa  218  3e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.91 
 
 
613 aa  218  3e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
619 aa  214  3e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
604 aa  214  5e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
597 aa  213  8e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
608 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
621 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
596 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  31.91 
 
 
613 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  31.91 
 
 
613 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  31.68 
 
 
613 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
613 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  31.3 
 
 
551 aa  209  9e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
613 aa  209  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  31.68 
 
 
613 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  31.68 
 
 
613 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  31.68 
 
 
613 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
591 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
609 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
608 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  32.88 
 
 
608 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
624 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
645 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
597 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
590 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
556 aa  203  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
423 aa  202  1e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
602 aa  202  2e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  28.81 
 
 
601 aa  201  2e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.8214e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
589 aa  201  2e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  32.73 
 
 
610 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
615 aa  197  4e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
623 aa  197  5e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
633 aa  197  5e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
669 aa  197  5e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00391757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
584 aa  197  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
595 aa  197  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
611 aa  197  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>