29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1724 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2006  stage IV sporulation protein A  100 
 
 
491 aa  999    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1724  stage IV sporulation protein A  100 
 
 
491 aa  999    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0919128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1021  stage IV sporulation protein A  58.54 
 
 
492 aa  614  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.143257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1401  stage IV sporulation protein A  53.69 
 
 
490 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1322  hypothetical protein  53.86 
 
 
492 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0897  stage IV sporulation protein A  53.35 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00196828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1163  stage IV sporulation protein A  54.47 
 
 
492 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.924983  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2111  stage IV sporulation protein A  51.63 
 
 
492 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.872668  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3378  stage IV sporulation protein A  53.21 
 
 
494 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000376953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1980  hypothetical protein  52.89 
 
 
492 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2601  stage IV sporulation protein A  51.63 
 
 
491 aa  541  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10560  Sporulation stage IV protein A  51.71 
 
 
504 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0464  stage IV sporulation protein A  48.98 
 
 
492 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1625  stage IV sporulation protein A  48.58 
 
 
492 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000633922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1319  stage IV sporulation protein A (spore cortex formation and coat assembly)  50 
 
 
492 aa  532  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.412877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2155  stage IV sporulation protein A  48.78 
 
 
492 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000439381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1697  stage IV sporulation protein A  47.97 
 
 
492 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1433  sporulation stage IV protein A  47.56 
 
 
492 aa  511  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.01082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1232  sporulation stage IV protein A  47.76 
 
 
492 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3780  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  511  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  normal  0.724274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1672  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000091842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1565  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.381762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1603  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000665055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1530  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1391  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00809532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1391  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1419  stage IV sporulation protein A  47.56 
 
 
492 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1636  stage IV sporulation protein A  47.36 
 
 
492 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.721522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2385  stage IV sporulation protein A  48.68 
 
 
491 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000269672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>