More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1605 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  100 
 
 
319 aa  636  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  99.37 
 
 
319 aa  634  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  57.97 
 
 
330 aa  338  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  49.23 
 
 
326 aa  312  4e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  43.33 
 
 
321 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  39.17 
 
 
351 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
371 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.90838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  39.26 
 
 
762 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  36.39 
 
 
366 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.68413e-06  hitchhiker  4.636e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
376 aa  200  2e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 
349 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
361 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.98419e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  37.85 
 
 
354 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.11 
 
 
360 aa  184  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
353 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  33.75 
 
 
348 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.55005e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.01 
 
 
391 aa  173  4e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  3.74023e-07 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  35.64 
 
 
380 aa  173  4e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.28029e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
375 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.95 
 
 
353 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.29 
 
 
357 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.95 
 
 
357 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  37.29 
 
 
357 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.95 
 
 
357 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3302e-10 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
357 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  37.29 
 
 
357 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.05483e-08 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.95 
 
 
357 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  36.95 
 
 
357 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  33.33 
 
 
312 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
357 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.54 
 
 
385 aa  168  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
357 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  34.97 
 
 
357 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.12 
 
 
354 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.67 
 
 
441 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  33.56 
 
 
406 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.46321e-05  unclonable  4.70096e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  32.2 
 
 
340 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
495 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.72 
 
 
386 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
369 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.51 
 
 
491 aa  154  3e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
521 aa  152  6e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
496 aa  152  6e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0580  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
375 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.56 
 
 
329 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
351 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
351 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  33.12 
 
 
349 aa  148  1e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  33.64 
 
 
349 aa  148  2e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
348 aa  147  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2170  glycosyl transferase family 4  29.61 
 
 
375 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.22 
 
 
407 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
355 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
360 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3144  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.51 
 
 
366 aa  141  1e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314399  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  34.84 
 
 
317 aa  141  1e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  29.97 
 
 
360 aa  140  2e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.46 
 
 
370 aa  140  4e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
372 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  31.76 
 
 
399 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  30.64 
 
 
394 aa  139  8e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  34.49 
 
 
352 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  30.35 
 
 
393 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.53 
 
 
359 aa  135  1e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  32.76 
 
 
600 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
542 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1295  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.75 
 
 
359 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
380 aa  132  7e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  1.9692e-06  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.62 
 
 
387 aa  132  7e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  31.58 
 
 
360 aa  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  33.23 
 
 
364 aa  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  33.23 
 
 
364 aa  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
333 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
336 aa  128  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  29.43 
 
 
554 aa  128  1e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
369 aa  128  1e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1602  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.89 
 
 
345 aa  128  2e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  8.60961e-06  normal  0.0685919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  27.41 
 
 
372 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3037  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.77 
 
 
359 aa  127  4e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0428  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase, putative  28.97 
 
 
375 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  29.55 
 
 
351 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
545 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  29.47 
 
 
340 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3031  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.12 
 
 
350 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111205  normal  0.0113432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2895  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  26.92 
 
 
349 aa  120  2e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03055  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  26.71 
 
 
353 aa  121  2e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.48 
 
 
375 aa  120  2e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  28.72 
 
 
437 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  27.35 
 
 
367 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2091  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase  28.57 
 
 
349 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.90177  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2670  glycosyl transferase, group 4 family protein  30 
 
 
355 aa  117  2e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
399 aa  117  2e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
399 aa  117  2e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2824  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.94 
 
 
357 aa  117  2e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0795  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.64 
 
 
377 aa  117  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
399 aa  117  2e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0892  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
342 aa  117  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  7.59355e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
405 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  28.7 
 
 
402 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.4 
 
 
403 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>