More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1591 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  98.69 
 
 
763 aa  1501    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 
763 aa  1521    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  37.08 
 
 
755 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  36.25 
 
 
760 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  36.4 
 
 
689 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  36.4 
 
 
689 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.31 
 
 
689 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  35.69 
 
 
691 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  35.88 
 
 
689 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  35.82 
 
 
691 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  35.73 
 
 
691 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  36.17 
 
 
689 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  35.98 
 
 
689 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  35.45 
 
 
689 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  31.78 
 
 
712 aa  348  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  32.07 
 
 
753 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.82 
 
 
706 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.82 
 
 
706 aa  313  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  31.11 
 
 
768 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  31.1 
 
 
702 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  29.99 
 
 
780 aa  282  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  30.22 
 
 
703 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.99 
 
 
785 aa  277  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  29.21 
 
 
748 aa  271  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.42 
 
 
702 aa  270  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  28.55 
 
 
776 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  28.65 
 
 
777 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  28.55 
 
 
776 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  29.57 
 
 
762 aa  266  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 
778 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  28.53 
 
 
776 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.23 
 
 
776 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.49 
 
 
777 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  28.61 
 
 
777 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  28.63 
 
 
778 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  28.8 
 
 
787 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  29.18 
 
 
764 aa  252  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.22 
 
 
768 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.06 
 
 
772 aa  237  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  24.25 
 
 
666 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  24.02 
 
 
706 aa  171  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.61 
 
 
659 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  25.04 
 
 
695 aa  167  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  23.05 
 
 
727 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  24.12 
 
 
719 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.51 
 
 
695 aa  163  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  22.15 
 
 
759 aa  163  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.66 
 
 
693 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.46 
 
 
736 aa  157  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  24.03 
 
 
684 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.68 
 
 
724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.3 
 
 
698 aa  149  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.7 
 
 
733 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  23.13 
 
 
792 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  23.97 
 
 
710 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.04 
 
 
732 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0025  UvrD/Rep helicase family protein  24.46 
 
 
852 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  21.89 
 
 
1048 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.65 
 
 
758 aa  130  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  22.17 
 
 
703 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  21.78 
 
 
861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  23.27 
 
 
771 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  35.24 
 
 
799 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  34.34 
 
 
706 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.02 
 
 
670 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.11 
 
 
741 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.17 
 
 
717 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.25 
 
 
645 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  30.86 
 
 
726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.56 
 
 
716 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.94 
 
 
767 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  29.29 
 
 
765 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  35.35 
 
 
705 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.48 
 
 
672 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  34.58 
 
 
750 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  21.95 
 
 
715 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.49 
 
 
804 aa  118  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.72 
 
 
705 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.27 
 
 
832 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  32.16 
 
 
680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.56 
 
 
706 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  27.58 
 
 
758 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  33.58 
 
 
724 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.91 
 
 
766 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  33.21 
 
 
724 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  33.21 
 
 
724 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.34 
 
 
757 aa  114  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.29 
 
 
813 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  29.02 
 
 
759 aa  114  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  27.16 
 
 
692 aa  114  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  34.55 
 
 
829 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  31.14 
 
 
735 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  29.86 
 
 
734 aa  114  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  31.03 
 
 
742 aa  113  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.18 
 
 
746 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  28.72 
 
 
761 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.94 
 
 
685 aa  112  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  111  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.72 
 
 
764 aa  111  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  28.08 
 
 
679 aa  111  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>