66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1575 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1575  GTP pyrophosphokinase-like protein  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.21431e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1858  GTP pyrophosphokinase-like protein  99.63 
 
 
268 aa  534  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  1.43095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0199  hypothetical protein  39.78 
 
 
349 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.32696e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2286  RelA/SpoT domain-containing protein  34.64 
 
 
221 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0856  hypothetical protein  34.1 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.877348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1423  RelA/SpoT domain-containing protein  31.65 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320561  normal  0.653719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  26.53 
 
 
570 aa  66.2  6e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.81 
 
 
247 aa  59.3  7e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  23.86 
 
 
356 aa  57.4  2e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  23.86 
 
 
356 aa  57.4  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  25.93 
 
 
191 aa  56.2  5e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  28.36 
 
 
388 aa  56.2  5e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  6.26045e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  33.33 
 
 
542 aa  56.2  6e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  25.29 
 
 
216 aa  55.8  7e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  25.95 
 
 
366 aa  55.8  7e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  4.08505e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  25.29 
 
 
216 aa  55.8  7e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  25.29 
 
 
216 aa  55.5  1e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  25.29 
 
 
216 aa  55.5  1e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  27.37 
 
 
223 aa  54.3  2e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1612  RelA/SpoT domain-containing protein  29.11 
 
 
577 aa  53.9  2e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  26.58 
 
 
217 aa  54.7  2e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  8.68379e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  26.16 
 
 
216 aa  53.5  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  29.11 
 
 
574 aa  53.9  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  24.71 
 
 
216 aa  53.5  4e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  24.71 
 
 
216 aa  53.5  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  24.71 
 
 
216 aa  53.5  4e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  26.16 
 
 
216 aa  53.1  5e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  23.21 
 
 
359 aa  52.8  5e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.11353e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  25.32 
 
 
216 aa  52.4  7e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  22.75 
 
 
362 aa  50.1  3e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  30.94 
 
 
226 aa  49.7  4e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.50379e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  25.88 
 
 
216 aa  50.1  4e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2070  RelA / SpoT domain protein  27.1 
 
 
329 aa  49.7  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000115922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  21.72 
 
 
362 aa  49.3  7e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.55841e-34 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  22.58 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.1111e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  21.56 
 
 
365 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.1471e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  25.27 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  24.87 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  23.56 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  27.27 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  28.98 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  24.4 
 
 
215 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  23.98 
 
 
359 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  27.68 
 
 
267 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.63425e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  24.4 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.91421e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  26.95 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  25.99 
 
 
203 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.32311e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  29.84 
 
 
212 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  27.21 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  23.92 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  26.22 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  23.92 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  26.22 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  25.32 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0352  RelA/SpoT domain-containing protein  26.32 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  30.08 
 
 
210 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  22.43 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  23.9 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  21.21 
 
 
224 aa  42.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  27.18 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>