More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1547 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  98.14 
 
 
429 aa  808    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  100 
 
 
429 aa  821    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  64.57 
 
 
436 aa  518  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.81 
 
 
437 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.51 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  51.75 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.14 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  57.04 
 
 
434 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.97 
 
 
433 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  48.48 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  48.48 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  48.95 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.36 
 
 
433 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  48.54 
 
 
465 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  48.54 
 
 
465 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.43 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.71 
 
 
431 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
435 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.55 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.48 
 
 
430 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  46.24 
 
 
431 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  46.71 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  46.15 
 
 
430 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.2 
 
 
433 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.86 
 
 
465 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  46.95 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  48.97 
 
 
441 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  49.2 
 
 
441 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.2 
 
 
441 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.2 
 
 
441 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  49.2 
 
 
441 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.96 
 
 
446 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  49.2 
 
 
441 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
431 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
441 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.2 
 
 
441 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  48.75 
 
 
441 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  49.43 
 
 
441 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.01 
 
 
442 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.06 
 
 
431 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  48.97 
 
 
441 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.89 
 
 
431 aa  383  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 
429 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.67 
 
 
462 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 
429 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.77 
 
 
431 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  44.63 
 
 
449 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.36 
 
 
435 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  44.39 
 
 
449 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.84 
 
 
441 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.73 
 
 
452 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  44.13 
 
 
433 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
449 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  46.95 
 
 
444 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  44.63 
 
 
429 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 
449 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.71 
 
 
465 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.79 
 
 
429 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.18 
 
 
444 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.18 
 
 
444 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.09 
 
 
430 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
432 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.09 
 
 
449 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 
449 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.99 
 
 
433 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  44.26 
 
 
429 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
434 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.67 
 
 
430 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  45.2 
 
 
453 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
434 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.45 
 
 
446 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.58 
 
 
457 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 
449 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  42.72 
 
 
445 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.58 
 
 
429 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  44.05 
 
 
436 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  42.72 
 
 
445 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.47 
 
 
441 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  42.72 
 
 
445 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  42.72 
 
 
445 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  45.2 
 
 
430 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  44.73 
 
 
494 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45 
 
 
467 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  45.67 
 
 
453 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>