More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1523 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  100 
 
 
178 aa  354  4e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  94.94 
 
 
178 aa  311  2e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  40 
 
 
173 aa  114  8e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.1948e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  38.61 
 
 
190 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  39.49 
 
 
190 aa  111  7e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  40.51 
 
 
198 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  40.14 
 
 
189 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  40.14 
 
 
186 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.37 
 
 
214 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  36.48 
 
 
220 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  35.4 
 
 
198 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.35 
 
 
200 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.35 
 
 
200 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  40.91 
 
 
177 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  40.82 
 
 
192 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.26894e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  40.26 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  41.32 
 
 
174 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  40.26 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  34.46 
 
 
209 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  35.5 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  37.72 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.68305e-08  unclonable  9.67083e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  37.72 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  38.18 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.23092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.26 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.97115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  39.1 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.07328e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  38.46 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.15638e-10  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  36.53 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.61769e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  38.85 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  35.64 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.79643e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  40.37 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  40.13 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  35.12 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  39.26 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  38.96 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.62301e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  39.61 
 
 
177 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  37.34 
 
 
201 aa  95.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.23532e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.53 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.88983e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  38.79 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  36.05 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  40 
 
 
187 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  39.39 
 
 
187 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  34.15 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  8.43557e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.37808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  39.39 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.09164e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.94308e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  39.39 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  39.39 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  35.62 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.8281e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  36.53 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  39.39 
 
 
187 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  41.1 
 
 
193 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  40.26 
 
 
177 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  35.67 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  32.6 
 
 
215 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  38.18 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  38.18 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  38.18 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  35.8 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  35.8 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  32.5 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0023  signal peptidase I  35.19 
 
 
174 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0767721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  33.72 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  37.86 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.14427e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.78 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.29 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.04372e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2156  signal peptidase I  37.01 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.73 
 
 
197 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  35.58 
 
 
214 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.28092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  38.31 
 
 
177 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0206  signal peptidase I  35.93 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.12 
 
 
200 aa  87.8  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  36 
 
 
183 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  33.5 
 
 
207 aa  86.3  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  31.67 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.72 
 
 
220 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  42.28 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1095  signal peptidase I  35.44 
 
 
248 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.41398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2503  signal peptidase I  39.71 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.29 
 
 
225 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  38.16 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  38.93 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  7.66434e-06  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3079  signal peptidase I  36.36 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  33.71 
 
 
225 aa  84.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  32.98 
 
 
216 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.54 
 
 
222 aa  84.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.52 
 
 
199 aa  84.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  38.57 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  34.39 
 
 
185 aa  84  1e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.84744e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>