More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1432 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  99.27 
 
 		 686 aa  1365    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 686 aa  1375    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 321 aa  171  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 381 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 302 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 339 aa  96.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  27.6 
 
 		 286 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 287 aa  91.3  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 310 aa  90.9  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  24.34 
 
 		 316 aa  90.9  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 300 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  24.47 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  36.5 
 
 		 502 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 298 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  22.31 
 
 		 300 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 299 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  25.48 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  21.91 
 
 		 745 aa  75.1  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  21.91 
 
 		 745 aa  75.1  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  26.52 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  27.56 
 
 		 292 aa  73.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 257 aa  73.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0147  two component transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.79 
 
 		 537 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 1201 aa  71.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 293 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 292 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0706  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 		 716 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 301 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0691  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 		 716 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 272 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.02 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.02 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30.39 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  30.39 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  31.31 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0171  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0320  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 724 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  29.01 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 550 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  26.69 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1405  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.099769  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 513 aa  67  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 304 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 336 aa  67  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 298 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3756  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 291 aa  66.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 326 aa  66.6  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6702  transcriptional regulator, AraC family  31.79 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 277 aa  65.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.28 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 961 aa  65.1  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3580  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  21.57 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  29.41 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001523  putative AraC-type regulatory protein  24.6 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  29.41 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>