22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1430 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1430  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000684885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1696  hypothetical protein  96.12 
 
 
206 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0320743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0511  hypothetical protein  31.69 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.499405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2881  hypothetical protein  23.62 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0692  hypothetical protein  31.25 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3194  hypothetical protein  33.71 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.428957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2667  hypothetical protein  27.67 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0451  hypothetical protein  32.47 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2556  hypothetical protein  34.23 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00890618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3198  hypothetical protein  28.24 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0022081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2379  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  25.13 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1515  hypothetical protein  26.88 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1992  hypothetical protein  31.94 
 
 
271 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.388122  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0451  hypothetical protein  28.3 
 
 
436 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1865  hypothetical protein  26.92 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4147  hypothetical protein  25.26 
 
 
439 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0660  hypothetical protein  25.67 
 
 
215 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.614031  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2821  hypothetical protein  23.26 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0662  hypothetical protein  24.09 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1684  hypothetical protein  24.46 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3187  hypothetical protein  26.43 
 
 
426 aa  41.6  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>