More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1389 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
528 aa  1082  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.09109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
528 aa  1082  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  6.67125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.53 
 
 
532 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.11 
 
 
541 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  4.40496e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.56 
 
 
530 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.25 
 
 
527 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.71221e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.28 
 
 
539 aa  471  1e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  9.55018e-07  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.69 
 
 
538 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.69 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
533 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.55 
 
 
511 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  51.24 
 
 
529 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  51.69 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.69 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  51.69 
 
 
528 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  51.47 
 
 
525 aa  455  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.05 
 
 
533 aa  453  1e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.92 
 
 
541 aa  453  1e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.41 
 
 
527 aa  455  1e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.47 
 
 
525 aa  455  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  45.75 
 
 
579 aa  454  1e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  43.24 
 
 
656 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  43.1 
 
 
572 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.24 
 
 
546 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.35 
 
 
530 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  3.41148e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.88 
 
 
546 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.45 
 
 
531 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52 
 
 
466 aa  445  1e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.82 
 
 
584 aa  446  1e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.23 
 
 
532 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.5 
 
 
527 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
538 aa  439  1e-122  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.01 
 
 
565 aa  441  1e-122  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.66 
 
 
529 aa  440  1e-122  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.54 
 
 
530 aa  441  1e-122  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.59 
 
 
550 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.47 
 
 
467 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.77 
 
 
550 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  41.43 
 
 
530 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.87 
 
 
562 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.07 
 
 
595 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.01 
 
 
590 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.38 
 
 
561 aa  417  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.58 
 
 
482 aa  418  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.9 
 
 
543 aa  417  1e-115  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  40.51 
 
 
561 aa  417  1e-115  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.27 
 
 
514 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.63 
 
 
532 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.43 
 
 
646 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  45.96 
 
 
527 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.41 
 
 
528 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.58 
 
 
562 aa  408  1e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  43.42 
 
 
589 aa  405  1e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  48.82 
 
 
485 aa  406  1e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.7 
 
 
498 aa  405  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.05 
 
 
474 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.08 
 
 
574 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.14 
 
 
571 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.22 
 
 
579 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  46.95 
 
 
551 aa  396  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.32 
 
 
570 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.62 
 
 
590 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  39.15 
 
 
574 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  39.88 
 
 
531 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.73 
 
 
643 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
747 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.86 
 
 
599 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  38.94 
 
 
609 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
694 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 
609 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.31 
 
 
594 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.23 
 
 
595 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.7314e-06  decreased coverage  1.37402e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 
632 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.55 
 
 
536 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.94 
 
 
557 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.9 
 
 
564 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.63 
 
 
506 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  7.39492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 
559 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.63 
 
 
506 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.32471e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.94 
 
 
557 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.94 
 
 
557 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.78 
 
 
602 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.6 
 
 
610 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  46.51 
 
 
579 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  45.29 
 
 
528 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  45.54 
 
 
614 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.94 
 
 
611 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.54 
 
 
606 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.08 
 
 
617 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.24399e-05  unclonable  8.03743e-11 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.94 
 
 
731 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.01 
 
 
589 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.08 
 
 
617 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.68 
 
 
625 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.67 
 
 
605 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.29 
 
 
599 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.58 
 
 
623 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.6 
 
 
634 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  45.97 
 
 
581 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.67 
 
 
640 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>