227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1356 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  100 
 
 
161 aa  322  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  89.44 
 
 
161 aa  291  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  99.09 
 
 
112 aa  218  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  62.73 
 
 
161 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  60.51 
 
 
158 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  59.87 
 
 
158 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  59.87 
 
 
158 aa  187  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  59.24 
 
 
158 aa  187  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  59.87 
 
 
158 aa  186  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  59.24 
 
 
158 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  59.24 
 
 
158 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  58.6 
 
 
158 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  59.24 
 
 
158 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  59.24 
 
 
158 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  59.59 
 
 
158 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  9.66718e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  58.44 
 
 
158 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  46.5 
 
 
164 aa  153  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  48.72 
 
 
161 aa  145  2e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  47.02 
 
 
157 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  46.71 
 
 
161 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  43.14 
 
 
169 aa  140  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  44.38 
 
 
160 aa  138  4e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  44.38 
 
 
160 aa  138  4e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  45.16 
 
 
168 aa  137  4e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  44.16 
 
 
158 aa  137  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  4.0826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  42.76 
 
 
161 aa  135  3e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  43.67 
 
 
169 aa  135  3e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  44 
 
 
160 aa  132  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  41.67 
 
 
161 aa  131  4e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  43.51 
 
 
158 aa  131  4e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 
162 aa  127  8e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  41.18 
 
 
157 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.79 
 
 
159 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  40.54 
 
 
156 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  42.38 
 
 
158 aa  120  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  43.33 
 
 
157 aa  120  1e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  37.84 
 
 
162 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  39.33 
 
 
157 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  39.87 
 
 
155 aa  108  4e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  8.66016e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  40.4 
 
 
156 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  38.96 
 
 
168 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  38 
 
 
156 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  40.4 
 
 
156 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  39.07 
 
 
156 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  39.33 
 
 
156 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  39.33 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  36.25 
 
 
157 aa  104  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  35.71 
 
 
156 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  38.67 
 
 
156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  38.67 
 
 
156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  38 
 
 
156 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1565  hypothetical protein  98 
 
 
50 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 
161 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  37.16 
 
 
155 aa  101  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  38 
 
 
156 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  40.14 
 
 
169 aa  100  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  44.87 
 
 
157 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  1.16633e-08 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  38.16 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  35.95 
 
 
155 aa  99  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  38.16 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  43.59 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  37.18 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  3.39512e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  36.67 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  36 
 
 
160 aa  94  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  34.87 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  36.18 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  35.62 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  36.54 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  34.42 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  36.81 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  39.22 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  32.24 
 
 
170 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.80569e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  43.44 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  90.5  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  35.29 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  1.71099e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  35.26 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  34.81 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  41.67 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  34.64 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  35.29 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  35.26 
 
 
159 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  35.9 
 
 
159 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  30.82 
 
 
172 aa  89  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2187  hypothetical protein  38 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  37.33 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  37.18 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>