189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1345 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  98.97 
 
 
387 aa  780    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  100 
 
 
387 aa  787    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  57.62 
 
 
392 aa  463  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  57.4 
 
 
385 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  56.51 
 
 
387 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  54.97 
 
 
386 aa  427  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  57.11 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  55.56 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  51.94 
 
 
388 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  54.29 
 
 
390 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  52.65 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  54.4 
 
 
399 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  51.04 
 
 
396 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  53.97 
 
 
394 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  54.76 
 
 
396 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  49.61 
 
 
394 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  53.41 
 
 
387 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  51.99 
 
 
396 aa  361  1e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  48.21 
 
 
389 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  47.11 
 
 
383 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  45.74 
 
 
399 aa  341  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  49.1 
 
 
386 aa  338  8e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  45.29 
 
 
397 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.78 
 
 
405 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  44.84 
 
 
404 aa  308  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  40.77 
 
 
405 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  39.74 
 
 
386 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  39.48 
 
 
386 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  40.87 
 
 
387 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  38.86 
 
 
398 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  40.73 
 
 
409 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.34 
 
 
391 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  40.93 
 
 
379 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  40.84 
 
 
385 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  38.34 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.84 
 
 
385 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  40.06 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.69 
 
 
389 aa  272  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  39.37 
 
 
382 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  39.31 
 
 
382 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  39.84 
 
 
383 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  37.27 
 
 
372 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  37.99 
 
 
382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  37.99 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  38.6 
 
 
403 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  37.99 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  37.73 
 
 
382 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.73 
 
 
382 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.53 
 
 
383 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.53 
 
 
383 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.53 
 
 
383 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.32 
 
 
388 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  38.86 
 
 
395 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  38.74 
 
 
383 aa  262  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  36.92 
 
 
387 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  37.18 
 
 
393 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  37.09 
 
 
394 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  38.44 
 
 
388 aa  257  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  38.64 
 
 
383 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  36.95 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  38.79 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  37.6 
 
 
389 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  38.28 
 
 
388 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  38.12 
 
 
359 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  37.53 
 
 
386 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  37.99 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  37.6 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  40.95 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  35.31 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  37.86 
 
 
390 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  36.29 
 
 
384 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  34.64 
 
 
389 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.06 
 
 
384 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.23 
 
 
412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  37.67 
 
 
349 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.58 
 
 
380 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.85 
 
 
350 aa  225  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.85 
 
 
350 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  34.99 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  35.28 
 
 
381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  35.28 
 
 
381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  35.28 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  34.66 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  34.66 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  34.66 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  34.66 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  34.66 
 
 
381 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  35.54 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  35.43 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  32.96 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2677  cyclic nucleotide-binding protein  34.46 
 
 
393 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  33.33 
 
 
380 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  39.17 
 
 
351 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  34.14 
 
 
385 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>