More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1341 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1548  putative galactoside ABC transporter, galactoside-binding protein  97.74 
 
 
354 aa  679  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00850993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1341  d-galactose-binding periplasmic protein precursor  100 
 
 
354 aa  720  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.93689e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0801  putative galactoside ABC transporter  61.86 
 
 
342 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.269097  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0942  D-galactose/D-glucose ABC transporter, periplasmic D-galactose/D-glucose-binding protein  61.11 
 
 
324 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.997032  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2327  galactose/glucose-binding protein  56.55 
 
 
350 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2467  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  57 
 
 
330 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2429  D-galactose-binding periplasmic protein  53.98 
 
 
332 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2566  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57 
 
 
330 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3017  galactose-binding protein  57 
 
 
330 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.013396 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1061  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.25 
 
 
331 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2329  galactose/glucose-binding protein  51.41 
 
 
342 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2336  D-galactose-binding periplasmic protein  53.69 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.777429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2425  D-galactose-binding periplasmic protein  53.69 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2381  D-galactose-binding periplasmic protein  53.69 
 
 
332 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2284  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  52.72 
 
 
332 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2445  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  52.72 
 
 
332 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1508  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.72 
 
 
332 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3283  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  53.3 
 
 
332 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.69006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2297  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  52.72 
 
 
332 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.897545  hitchhiker  0.00310991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2995  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  57.65 
 
 
331 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0816  galactose ABC transporter, periplasmic galactose-binding protein  52.72 
 
 
332 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.685859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1498  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  52.44 
 
 
332 aa  359  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1563  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.17 
 
 
330 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2750  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  51.29 
 
 
332 aa  355  9e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0317  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.42 
 
 
332 aa  331  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2328  galactose/glucose-binding protein  45.43 
 
 
344 aa  306  4e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1702  galactose-binding protein  43.58 
 
 
353 aa  270  3e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2330  galactose/glucose-binding protein  42.99 
 
 
337 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.783763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2243  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.06 
 
 
367 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4011  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 
319 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4268  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.8 
 
 
309 aa  121  2e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2473  periplasmic substrate-binding protein  28.3 
 
 
306 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.265832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 
349 aa  117  4e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 
349 aa  117  4e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 
349 aa  117  4e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50140  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  27.36 
 
 
310 aa  116  7e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1961  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.41 
 
 
309 aa  116  7e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1684  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 
313 aa  115  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2238  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.65 
 
 
306 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442154  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2217  galactose/glucose-binding lipoprotein  34.5 
 
 
403 aa  113  4e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.67 
 
 
281 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4184  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 
309 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3856  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 
309 aa  112  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772543  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4893  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 
309 aa  112  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4971  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 
309 aa  112  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.155709  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2395  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.32 
 
 
307 aa  112  1e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50130  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  26.86 
 
 
308 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2489  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.8 
 
 
314 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.776207  normal  0.649417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1047  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.79 
 
 
317 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2780  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 
351 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2807  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 
351 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3049  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding, putative  27.24 
 
 
308 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00910782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.61 
 
 
351 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0298901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3265  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.72 
 
 
311 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610984  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7805  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.78 
 
 
307 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0054  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.16 
 
 
309 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4568  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.74 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1964  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 
305 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0494168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3490  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.69 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.01 
 
 
313 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2771  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 
314 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789772  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5068  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.86 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.449495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50320  ABC transporter substrate binding protein  26.14 
 
 
315 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.65 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6620  D-xylose transporter subunit XylF  27.15 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1891  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.12 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.189915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3164  Monosaccharide-transporting ATPase  27.81 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1681  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.21 
 
 
316 aa  96.7  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0942  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000643298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1424  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1402  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.7 
 
 
308 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1304  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.39 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26220  Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator protein  27.04 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1642  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.73 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.07495e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0259  xylose binding protein transport system  24.66 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.465034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0064  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.89 
 
 
310 aa  92.8  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0063  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.6 
 
 
309 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1457  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.3 
 
 
362 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1922  solute-binding protein  31.54 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.25 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5353  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.51 
 
 
309 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.338123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.24 
 
 
309 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.87 
 
 
358 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3185  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.17 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208726  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1241  putative rhizopine-binding precursor signal peptide protein  25.88 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0362  carbohydrate ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  26.38 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1793  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  26.38 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0457  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.38 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0756  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.35 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0825121  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1987  putative solute-binding component of ABC transporter  26.59 
 
 
378 aa  84.7  2e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3174  D-xylose ABC transporter, substrate-binding protein  23.75 
 
 
342 aa  84.7  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.285981  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2925  D-xylose ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.23 
 
 
346 aa  85.1  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.8 
 
 
321 aa  84.7  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.74741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2569  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.7 
 
 
336 aa  85.1  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  25.95 
 
 
322 aa  84.3  3e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1399  rhizopine-binding protein precursor  25.71 
 
 
328 aa  84  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000528006  normal  0.827429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0499  multiple sugar transport system (multiple sugar- binding protein)  25.95 
 
 
379 aa  82.8  7e-15  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10489  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2644  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26 
 
 
335 aa  82.4  9e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1630  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.3 
 
 
329 aa  82  1e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>