More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1323 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  100 
 
 
423 aa  830  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  1.11673e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  99.76 
 
 
423 aa  828  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  5.68419e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  40.19 
 
 
417 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.6098e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  31.97 
 
 
426 aa  243  4e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.39361e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  33.33 
 
 
459 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  29.12 
 
 
433 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  30.05 
 
 
420 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  33.02 
 
 
430 aa  216  6e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  29.38 
 
 
421 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  29.33 
 
 
625 aa  189  9e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
425 aa  167  3e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  31.07 
 
 
412 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  35.43 
 
 
450 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  2.6878e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  31.61 
 
 
425 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  6.84076e-06  decreased coverage  7.60195e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  29.2 
 
 
425 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  34.08 
 
 
452 aa  142  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  31.58 
 
 
451 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.41787e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.42 
 
 
461 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32 
 
 
463 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  35.34 
 
 
462 aa  134  4e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  31.56 
 
 
444 aa  134  4e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.27 
 
 
460 aa  132  8e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  25.74 
 
 
413 aa  132  8e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  33.48 
 
 
463 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  31.09 
 
 
453 aa  132  1e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  32.74 
 
 
445 aa  132  2e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  35.87 
 
 
467 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31.17 
 
 
462 aa  130  4e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  33.02 
 
 
454 aa  130  4e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31.17 
 
 
462 aa  130  5e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.44 
 
 
450 aa  130  5e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  9.87618e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  33.94 
 
 
458 aa  129  8e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  30.77 
 
 
451 aa  129  1e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  28.33 
 
 
461 aa  129  1e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  33.04 
 
 
454 aa  126  7e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  23.42 
 
 
454 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  30.04 
 
 
473 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  33.48 
 
 
450 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  30.04 
 
 
486 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  30.36 
 
 
445 aa  122  1e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  30.22 
 
 
454 aa  122  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  33.92 
 
 
445 aa  122  1e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  24.42 
 
 
424 aa  122  1e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  29.78 
 
 
466 aa  122  1e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  26.89 
 
 
440 aa  121  2e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  30.04 
 
 
469 aa  121  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  29.15 
 
 
469 aa  121  2e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  29.15 
 
 
469 aa  121  2e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  31.78 
 
 
449 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  29.02 
 
 
442 aa  120  4e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  32.94 
 
 
459 aa  120  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.06288e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  25.57 
 
 
474 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  28.57 
 
 
482 aa  120  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  24.76 
 
 
447 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  31.19 
 
 
447 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  29.15 
 
 
468 aa  119  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  29.15 
 
 
468 aa  119  1e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  30.8 
 
 
449 aa  119  1e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  29.6 
 
 
468 aa  118  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.67 
 
 
542 aa  117  4e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.04 
 
 
443 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.42012e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  32.44 
 
 
449 aa  116  7e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  27.85 
 
 
457 aa  116  7e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  28.89 
 
 
468 aa  116  8e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  25.86 
 
 
426 aa  116  8e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  27.14 
 
 
431 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  26.3 
 
 
445 aa  115  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  28.25 
 
 
486 aa  115  2e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  30.97 
 
 
480 aa  114  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  29.09 
 
 
457 aa  115  2e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.15 
 
 
461 aa  115  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  28.15 
 
 
435 aa  115  2e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.94 
 
 
446 aa  115  2e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.15 
 
 
461 aa  115  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  23.84 
 
 
430 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.39 
 
 
446 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  26.72 
 
 
429 aa  114  4e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  30.8 
 
 
444 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  24.56 
 
 
427 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  22.58 
 
 
431 aa  113  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  29.52 
 
 
461 aa  112  8e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  29.15 
 
 
454 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  23.9 
 
 
435 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  29.65 
 
 
457 aa  112  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  27.69 
 
 
457 aa  112  1e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  33.04 
 
 
449 aa  112  1e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  27.69 
 
 
457 aa  111  2e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  8.13528e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  27.69 
 
 
457 aa  111  2e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  27.69 
 
 
457 aa  111  2e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  29.52 
 
 
449 aa  111  2e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  29.52 
 
 
449 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  26.91 
 
 
471 aa  110  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  26.72 
 
 
427 aa  110  4e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1907  magnesium transporter  27.6 
 
 
445 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  27.11 
 
 
452 aa  110  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  25.77 
 
 
428 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  24.48 
 
 
430 aa  109  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  30.23 
 
 
444 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  30.74 
 
 
459 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  33.48 
 
 
441 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>