More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1299 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  64.92 
 
 		 248 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  60.73 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  62.7 
 
 		 646 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  60.49 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  60.49 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  60.49 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  60.49 
 
 		 251 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  58.7 
 
 		 250 aa  297  8e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  59.67 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  60.08 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  59.27 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  56.85 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  58.06 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 251 aa  286  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  57.32 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  56.63 
 
 		 251 aa  285  5e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.06 
 
 		 650 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  54.25 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 		 251 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  53.57 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  53.63 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  53.04 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 252 aa  268  8e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.23 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  54.44 
 
 		 251 aa  265  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  52.82 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  54.07 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  52.02 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.62 
 
 		 654 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 655 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  54.19 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  53.74 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  48.39 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 275 aa  246  2e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 241 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 253 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 251 aa  241  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 298 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  49.2 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 687 aa  238  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 263 aa  235  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 260 aa  234  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13911  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.303825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10411  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  47.6 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.79 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09041  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.535393  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0971  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>